大多数中重度抑郁症，由于缺乏自知力，而且有的会出现自残、自杀行为，因此大多需要住院治疗。住院治疗，会根据病情给予心理治疗以及新型抗抑郁治疗，而对药物疗效不敏感或者疗效差者，还可以进行无抽搐电休克治疗等。
可以住院治疗的，中重度的抑郁症，会有一些自杀的观念，或者自杀的行为，那么危险系数是很高的，积极的使用抗精神病药物的治疗的，才能帮助的了。轻度抑郁不必住院，接受门诊治疗即可。
如果是重度抑郁，存在消极行为，比如自杀自伤，就需要考虑住院治疗。如果只是情绪低落，没有严重的消极行为，能够配合吃药，可以不住院。住院治疗的手段比较多，包括药物的正规使用，足量足疗程，在急性期有自杀自伤风险的时候，可以使用电休克治疗，快速控制症状。
可以用来治疗伴有精神病症状的抑郁，也可以用来治疗伴有激越症状，严重失眠、焦虑症状的抑郁，也可用来治疗有较严重进食障碍的抑郁的初期的对症治疗，疗效肯定，副作用相对较小。但此药用于抑郁症时不宜长期使用，因为长期使用会出现代谢综合征，女性会导致停经、泌乳等内分泌方面的副作用。
临床上用于治疗抑郁症的西药主要是劳拉西泮、奥沙西泮等，可能产生眩晕、乏力等不良反应，并有一定的用药成瘾性。因此可以服用中成药来改善其不足，如同仁堂巴戟天寡糖胶囊。
抑郁症在中医学上又被称为“郁证”，是情志不遂所导致的。肾阳亏虚是抑郁症的主要病机，机体阳气不足，运行不畅，则不能布达全身，使神失温养，从而出现意志消沉、兴趣减弱、精神萎靡等抑郁症状。同仁堂巴戟天寡糖胶囊是由中药材巴戟天提取制成，患者在医生的指导下服用该药，可以调理抑郁情绪，改善心绪低落，调节睡眠，恢复精神，从而从较深层面治疗抑郁症。
需注意的是，巴戟天寡糖胶囊适用于抑郁症辨证为肾阳虚证的患者，若为其他辨证分型的患者，应在医生指导下使用对症的药物进行治疗。
抑郁症患者除了采取药物治疗以外，还可以应用按摩疗法。首先需要按摩的穴位是太阳穴，此穴位能有效的起到醒脑安神的作用，睡前轻柔按摩，舒缓紧张大脑，有利于睡眠，其次是檀中穴，该穴位按摩能够起到舒缓心烦，心燥，烦闷易乱的不良心理感受，最后可以进行足部的太冲道，行间两穴位的按摩。具体穴位需要专业按摩师帮助患者指导治疗。