一般情况下，骶管囊肿大部分的病例都是先天性的，都是因为先天不完整而导致的。感染因子及外伤均可能导致该种疾病。具体分析如下：
1、先天性畸形：骶管囊肿多是先天性的，早期囊肿与蜘蛛膜下腔相连，有脑脊液流入，到了晚期，由于脑组织不能正常排出，或者是压力变化，造成囊肿的形成，从而引起腰部、骶尾部、会阴部等一系列的症状。
2、后天因素：骶管神经根和周边组织发炎是导致骶管囊肿的主要原因。此外，因创伤或医疗原因造成的硬脊膜缺损而形成囊肿。
儿童囊肿引起的原因主要是胎儿发育异常，起源于一位胚胎残余组织的外胚层组织，是胚胎晚期，在继发性脑细胞形成时，将表皮带露的结果。资料显示，结核性脑膜炎行鞘内注射后，脑囊肿可为多发，囊肿缺乏血管，实验上，直接把皮肤碎片注入小鼠的脊髓，产生同样的囊肿。
导致卵巢囊肿的原因有很多，一般与遗传因素、内分泌水平、心理压力、乱用激素类药物、滋补品等有一定的关系。饮食结构不合理、生活习惯不好、进食的食物受到污染都有一定的关系。患有卵巢囊肿要引起注意，此时容易出现感染、卵巢肿瘤、卵巢囊肿蒂扭转等疾病。如果是单纯的卵巢囊肿比较小，对身体一般没有影响，但是需要定期复查。
肾囊肿是有很多发病原因，如果家人亲属有得肾囊肿疾病的，可能会出现基因突变，还有就是，感冒也会导致肾病患者肾脏损伤，肾囊肿是一种比较常见的良性病变，也有可能是身体的抵抗力比较低而造成疾病出现。要提高自身免疫力。
子宫囊肿又叫宫颈纳氏囊肿，通常是慢性宫颈炎引起的。宫颈纳氏囊肿是一种常见的疾病，只要不是很大，一般不会对身体造成太大的影响。
宫颈纳氏囊肿的病因是由于宫颈上有大量的腺管开口，由于炎症的缘故，腺管被阻塞，使子宫颈分泌的黏液得不到及时排出，堆积在宫颈管内，就会形成囊肿。
通常宫颈纳氏囊肿并没有什么症状，病人不用太过担心，只要定期进行宫颈防癌筛查就可以了。
膝半月板囊肿的病因目前尚未完全明确，其病因与退行性变性、畸形、外伤等因素有关。
1.退行性变性：膝关节半月板囊肿与肌腱囊肿是由退行性病变所致。原发病原因是由于结缔组织发生变化，而显微镜下则是由纤维状变性引起的，而纤维状的结缔组织已经被分解。
2.畸形：多数发生在半月板的边沿。较小的囊肿仅2毫米，被纤维包裹。内侧膝关节半月板囊肿是一种罕见的疾病，其原因是由于内侧副韧带与内侧半月板之间存在着密切的联系，没有可能存在的腔隙，而且内部半月板的可动性较低，很少受到损伤。侧半月板存在大量的空洞，并不存在粘连。囊肿多发生在半月板的外周处，通常会扩张并伴有凝胶状的东西，在外伤后会出现暗棕色的脓包，随后会慢慢的发展成为一个囊腔。
3.外伤：外伤导致的半月板囊变性，与纵裂症类似，由于活动导致的局部流血和囊变性。部分患者在受伤后6~12月出现了囊性改变。损伤部位多在外侧半月板中1/3处，而外侧半月板的边沿比内半月板的边沿要粗，容易造成损伤。
