危害有导致男性不育症，输精管堵塞会导致精子和卵子不能结合，出现不育。男性出现输精管堵塞后，会引起附睾里的内部压力升高，导致睾丸血液的循环，还会影响睾丸的生精功能，出现死精症或者是无精症的情况。
单侧输精管道阻塞，对生育影响不大；双侧堵塞时，精子不能正常排出，将导致不育。主要原因有输精管先天未发育或发育不良，感染，肿瘤或外伤、手术等。及时治疗，治疗期间不要进食辛辣食物。
输精管先天未发育或发育不良、与附睾不相通等，常伴精囊不发育，致精液量少，无精子。炎症性狭窄：各种致病菌使输精管发炎，形成瘢痕，致管腔闭塞。严重者致无精症。肿瘤：来自输精管本身或邻近器官肿瘤压迫所致管腔不通，也是造成无精症的原因之一。
输精管堵塞，首先可能会造成男性的不育，因为精子不能通过输精管排出。另外，会造成睾丸的萎缩，还有就是会引起并发症，比如睾丸缩小等。另外，还会对病人的心理造成很大的阴影。
输精管堵塞是有危害性的，会引起精索静脉曲张尿痛以及泌尿的感染和男性的不育。还危害到身心健康，有严重的心里压力。输精管堵塞之后，会出现死精症或者是无精症的情况。输精管堵塞会导致输精管管道梗阻。还会影响免疫系统的附属性腺。