乙型肝炎的临床并发症常有以下几种：血液学疾病：主要是再生障碍性贫血和溶血性贫血；心血管疾病：如心肌炎、心包炎、结节性动脉周围炎等；肾病：这是乙型肝炎较常见的并发症，早期无症状蛋白尿、血尿。甚至出现颗粒管型。这是可变的和持久的。逐渐发展为肾功能不全。
肝硬化即使是早期也是不可逆转的。肝硬化主要是由于广泛肝细胞坏死，残余肝细胞结节再生，纤维结缔组织增生和纤维隔形成，最终导致肝小叶结构破坏和假小叶的形成。因此肝硬化和单纯的肝纤维化不同，是一种不可逆性病变。
乙肝是因为乙肝病毒导致的，而不是因为酒精肝。
乙肝的治疗主要有对症支持治疗和抗病毒治疗，其中干扰素核苷类似物主要有长效干扰素和短效干扰素两种。拉美夫定、阿德福韦、替比夫定、恩替卡韦、替诺福韦等都是一种比较稳定的药物。
中国肝病的治疗指南建议以长期的干扰素、恩替卡韦、替诺福韦等为主，具体情况要根据个人情况，在专业医师的指导下进行相应的治疗。
乙肝小三阳多数患者病毒水平可能较低、传染性较弱，肝功能正常者，这部分病人可无严重易发展成肝硬化。
部分乙肝小三阳由于乙肝病毒C区变异所致，病毒水平将长期保持相对高水平，就会导致肝脏反复的损伤，在肝脏多次受损后，则易形成肝硬化。临床上所见肝硬化中，乙肝小三阳状态的确占了很大比例。
肝硬化必须接受标准抗病毒和其他治疗，乙肝小三阳患者无肝硬化时，具有抗病毒治疗指征者，规范抗病毒治疗，通常不会发展为肝硬化。
肝硬化是一种病理现象，是由于肝脏组织细胞在病理因素作用下发生的纤维化改变，肝硬化有可能会导致肝癌。乙肝长期迁延不愈是可以转化肝硬化的，肝硬化是不可逆的。这样的情形建议及时做肝功能检查，发现异常要及早进行治疗，避免加重肝硬化。
需要积极治疗，通常会出现肝功能异常，可有腹胀恶心呕吐，食欲不振倦怠乏力，腹水等症，经过正规治疗，少数可康复，就诊传染病科，检查治疗，遵医嘱治疗，注意休息劳逸结合，避免肝毒性药物，按时服药，定期复诊。