尿结石导致的疼痛有绞痛和钝痛，是间歇性的。可以沿同侧输尿管方向，放射至下腹部，会阴部，外生殖器，大腿内侧这些地方疼痛，也有可能放射至腰部。还可能会伴有恶心呕吐，但是吐后疼痛感也不能完全缓解；合并感染的时候，会出现寒战高热的现象，可以查泌尿系平片，有助于明确诊断。
3-5天，碎石后还会痛几天与病人的碎石手术方式，和病人的身体综合素质、小石头的多少、小石头排除的速度、是否用药、病人的喝水多少等因素有关。尿道结石体外碎石后如果排石干净应该不会再疼痛。
可以暂时使用某药物止痛，泌尿系结石形成是由饮食中可形成结石的有关成分摄入过多引起的，结石可见于肾、膀胱、输尿管和尿道的任何部位，平时没有症状，当剧烈劳动会突然出现剧烈的肾绞痛。
尿结石很痛可以采取体外冲击波碎石手术进行治疗。如果碎石失败，可以输尿管插管或者输尿管镜碎石清石治疗。手术后输尿管留置支架管一个月。碎石治疗如果失败通常都是结石时间太久了已经形成结石包裹所以只能手术碎石了。
如果是出现了泌尿系的结石，会因不同的部位，不同的大小，对泌尿系统产生不同的影响，从而出现不同的症状，多数结石会有腰腹部的疼痛，疼痛为绞疼，会比较剧烈，明显些的结石刺激尿道，可以出现尿频，尿急，尿疼的症状，黏膜损伤之后，还会有血尿的表现。