肛瘘常有肛周脓肿自行溃破或切开排脓的病史，此后伤口经久不愈，成为肛瘘外口，主要症状是反复自外口流出少量脓液，污染内裤，有时脓液刺激肛周皮肤，有瘙痒感，若外口暂时封闭，脓液积存，局部呈红肿，则有胀痛，封闭的外口可再穿破，或在附近穿破形成另一新外口，如此反复发作，可形成多个外口，相互沟通，如瘘管引流通畅，则局部无疼痛，仅有轻微发胀不适。
肛瘘多久能痊愈；手术后按时换药，平时注意卫生，勤清洗，便后清洗，一般需要2-4周可以痊愈。建立正常的膳食习惯，因肛瘘的发生与湿热有关，对于油腻饮食，可以内生湿热，所以不宜多吃。养成良好的排便习惯，每日排便后坐浴保持肛门清洁，对预防感染有积极作用。避免一直保持同样姿势，坐着工作的人每隔一小时要能走动三、四分钟。
挂线手术适用于高位肛瘘，是治疗高位肛瘘的最主要方法。挂线手术的优点：以线代刀行慢切割，在切断肛瘘管壁的同时，造成断端的炎症粘连，防止回缩，可以适当起到保护肛门功能的作用；挂线手术的缺点：挂线后由于疼痛，病人肛门总处于收缩状态，使肛门外的创面不能完全放开，往往使已勒开的创口又很快粘连在一起，结果是外口引流不畅，瘘管还易复发。
可以每天适当下床活动，如缓慢行走，有利于伤口的渗出分泌物流出来。术后半个月，对低位单纯肛瘘手术，创面不大的患者，可到户外散步、打太极拳、做深呼吸运动、练气功、做体操等。
做肛瘘手术需要住院的时间，因人而异，大部分情况下都是在一周左右，出院后还需要在家休养一两周才可以，自己注意饮食结构，需尽量保持营养丰富清淡的，预防便秘，大便之后还需要注意对伤口处进行清创消毒，避免大便刺激伤口。