引起阴茎短小的原因一般有5种：1、营养没跟上2、肥胖的因素3、阴茎的大小也受温度4、男性包皮过长是常见的现象5、性生活不规律如：过度的手淫也会导致男性阴茎短小的原因，如果男性过度的手淫，就会使肾脏在发育时无能量去壮大发育性器官，形成男性阴茎短小。
出现乳房增大，睾丸阴茎缩小的情况可考虑两方面问题，一个是中枢性一个是外周性，如为垂体病变可导致雄性激素分泌减少导致第二性征减退出现目前症状，也可能为睾丸本体出现异常，分泌雄性激素不足导致男性体征逐渐消失，根据这两方进行检查，基本可确定病因。
睾丸萎缩和睾丸鞘膜积液都会导致睾丸小，要去正规的医院，做一个B超，或是相关的检查项目，找到睾丸小的病因，看病人的病情和病变，来确定或指定治疗方案，再进行，进一步治疗。
睾丸小可以到医院进行检查，看有没有内分泌激素分泌不足，或者做个精液常规的检查，看精液的质量是否是正常的，如果检查都没有任何的问题，没有什么大的影响，也不需要进行治疗。
阴茎短小满脸痘，可以考虑以下疾病：尖锐湿疣，或者是毛囊炎。如果有性生活史，阴茎上长了小痘痘，要考虑是否是疱疹，如果没有性生活史，考虑毛囊炎症，可以先清洁之后碘伏消毒，观察两天。
阴茎短小，先去医院抽血化验性腺系列。如果正常，最常见病因就是手淫和包皮过长，尽快彻底戒掉手淫，手淫导致发育期发育不良或者停止，阴茎海绵体挫伤，阴茎越来越短小，增加营养，多吃高蛋白食物，牛羊肉，海参，另外包皮过长、肥胖也是阴茎短小病因，如果有包皮过长割掉包皮，肥胖必须减肥，对发育期阴茎发育有好处。