肛瘘是必须要做手术医治的，这是唯一一种可以治愈肛瘘的办法，平时使用的药物，只是可以起到缓解和控制的作用，不可能治愈的。注意肛门口的清洁卫生，便后温水清洗肛门口。
患有肛门脓肿的一般都可以用多普勒超声检查是否有肛瘘，它是可见的，到三级以上的正规医院做肛肠检查，可以做肛门指检查和肛门内窥镜检查，也可以进行局部彩色多普勒超声和CT检查，找出症状的原因治疗，必要时手术治疗。
肛瘘饮食应以清淡为主，益食用具有润肠通便的食品如新鲜蔬菜和水果，益食用富含优质蛋白质的食物，如牛奶，豆类。可提高机体免疫力，韭菜含有丰富的蛋白质，膳食纤维，氨基酸，维生素以及矿物质，具有润肠通便，补肾壮阳，温中益气等功效。
约2-3周左右。可采用切开加挂线疗法，是高位肛漏的一种常用手术方法。此法具有简便、经济、不影响肛门功能、瘢痕小等优点。其机理是切开部分漏管周围组织后利用结扎线的机械作用。
肛瘘如果是比较轻微的肛痿程度，利用微创手术之后是可以将内口的位置顺利进行关闭，而在关闭之后就可以达到治疗的效果性，而如果是比较重的肛痿程度，微创手术未必就能够完全性关闭，甚至是关闭之后还会容易复发，所以想要选择微创手术，也是要看肛痿的程度性。
