阴茎短小的原因与种族，家族，遗传，包皮过长，内体寒、怕冷、体内阳气严重不足以及青春期营养不足，还有就是性生活过度，手淫过度等情况有关。常吃牛肉，羊肉，狗肉，豆制品可能使阴茎和第二性征的发育。
性功能障碍的病人可以适当服用具有“大补”功效的药物，节制性生活，多运动增强体质，保证充足睡眠，饮食清淡一些，少吃辛辣刺激性食物，坚持每天都做提肛运动，或者深蹲起运动。
治疗性功能障碍关键是靠自身调整，药物只是帮助纠正不良状态，而不是终生靠药物维持，多食优质蛋白质优质蛋白质主要是指各种动物性食品，可提出供人产生精子所需用要的各种氨基酸。一些动物性食品本身就含有一些性激素，有利于性欲的提高。
伟哥可以操纵阴茎中的酶，促使阴茎海绵体充血膨胀，从而使阴茎勃起，但它并不是壮阳药，也不能引发和提高性欲，伟哥必须在性欲冲动出现后才起到作用。使男性失常的勃起功能恢复正常，并不会使勃起功能时间出现超常的现象。且1天只能服用1次。在性生活前半小时到一个小时之内服用都有效。但想要达到最佳的效果，最好是通过自己服用后的效果来确定此药有一定的副作用。
检查性功能主要是泌尿外科或者是生殖内科。
患者出现性功能异常时，可以去医院的泌尿外科或者是生殖内科就诊，主要检查的内容有血液、尿、肝、肾功、前列腺、精液等。如果有必要的话，可以做CT和B超来做生殖器的检测。
当化妆发生性功能失调时，不要避而不谈。建议到正规的医院进行检查。同时要注意改善自己的饮食，多做运动。
手术治疗适用于静脉性和动脉性勃起功能障碍：阴茎静脉手术包括阴茎背神经降敏术、阴茎背深静脉结扎术、阴茎脚静脉结扎术、坐骨海绵体肌折叠术、尿道海绵体剥脱术、髂内静脉结扎术。