矮小症最佳治疗时间是3~12岁。
矮小症是小儿内分泌科的一种常见病症，一般小于同龄人两个标准差就是矮小症。矮小症应该尽早进行治疗，如果是女性来例假后，男孩的嗓音发生了变化，说明孩子已经到了青春期，这时候进行干预可能会起到很大的作用。最关键的是，在早期介入的过程中还有很大的余地，而且有的孩子的体重也比较轻，治疗起来也会比较方便，所以在发现孩子个子矮小的情况下，要及时的进行治疗，这样才能达到最好的效果。如果在孩子的骨骺完全闭合之后，才进行干预，可能会没有效果，进而给孩子带来不良影响。
矮小症患者通过及时有效的治疗，一般可临床治愈。
矮小症一般针对其发病原因进行治疗。由生长激素缺乏所致身材矮小，治疗时间约为两年。由性早熟所致的矮小，治疗时间约为1.5-2年。只要达到成年男性身高1.6米以上，女性身高1.5米以上，即为临床治愈。儿童若诊断为矮小症，应尽早治疗，促进患者的生长达到正常平均水平，一旦错过治疗最佳时机，骨骺端已经愈合，则无法达到理想的治疗效果。所以，家长应该时刻关注孩子的生长，发现异常及时到正规医院诊断治疗。
矮小症不治疗通常会对身体健康造成影响。
矮小症是由多种原因引起的。常见的遗传性疾病是家族型矮小症遗传疾病。这些先天因素如果不及时治疗，一般会导致孩子身材矮小。营养不良、骨骼疾病、代谢性疾病、内分泌疾病等，如果不及时治疗，可能会导致智力低下、语言障碍、运动障碍等。建议患者及时就医进行治疗，避免影响身体健康。
3~12岁是治疗矮小症的最佳年龄。但由于矮小症的病因不同，治疗的时机和方法也不一样，一般不建议超过12岁，因为12岁以后骨骺线可能会闭合，闭合后即使治疗，也不会有明显的长个。
1、甲状腺功能减退：如果矮小症是由于甲状腺功能减退引起的，应及时治疗，平时要多吃碘剂和加碘盐，因为甲状腺功能减退可能会影响大脑的智力发育，所以要及时治疗；
2、生长激素缺乏：如果矮小症是由生长激素缺乏引起的，不需要过早的治疗，因为3岁前很难判断是不是生长激素缺乏引起的。如果生长激素缺乏被确诊，3-12岁的孩子可以通过打生长激素来治疗。
矮小症还会受到营养、环境等因素的影响，治疗的时间要根据具体的病因来确定，同时还要注意心理治疗，因为矮小症可能会受到周围同学、朋友的歧视。平时多晒太阳，促进钙的吸收。可以多做一些运动，比如跳远、打篮球等，促进骨骼发育。
水针和粉剂，都是不同的剂型，并不能决定谁更好。
生长激素质量的优劣取决于其比活力，其比活度越高，说明其生产技术和质量也就越高。目前市面上的生长激素分为两大类，一类是比活性3.0，一类是符合欧洲标准的比活度2.5。结果表明，生长因子水针的比活度达到3.0；粉剂中，其他的都是2.5~3.0，与同样活性的生长激素相比，其效果是一样的，但是需要花费1-3年的时间，而且治疗成本也比较高。生长激素的选择要看个人的经济状况，不要盲目的选择昂贵的。