注射乙肝疫苗后，人体免疫系统会对疫苗中的蛋白质抗原产生反应，一般在注射疫苗后大约一个月左右就会产生抗体，刚开始抗体水平很低，到了第二针，抗体水平就会迅速上升，很快就能抵抗乙肝病毒感染。接种乙肝疫苗后，从理论分析半个月后会逐渐产生抗体。不过早期抗体的浓度比较低，接种三针结束后，90%以上的患者都会出现保护性抗体。
乙肝抗体可能会自己产生。
一般情况下，不打乙肝疫苗，亦未被乙肝病毒传染，就是没有乙肝抗体，我们在注射乙肝疫苗后就能产生乙肝抗体了，自然也是，若人体内有少量乙肝病毒感染，通过身体的免疫力，彻底清除病毒，本身就有抗体生成，能产生抗体。因此，抗体的生成可分为两类，其中之一是乙肝疫苗的注射，其中之一是先前感染乙肝病毒的人，但机体已消灭病毒，并产生抗体，对乙肝预防，其中效果最好的是乙肝抗体生产，因此建议及时接种疫苗。
注射乙肝疫苗后通常会产生抗体。
一般来说，注射乙肝疫苗后，大多数人都会产生乙肝抗体，但还是有少部分人会产生抗体，这可能与身体对乙肝疫苗的反应弱有关，或者本身就感染了乙肝病毒。乙肝病毒携带者表面抗原呈阴性。乙肝病毒携带者打疫苗时不会产生抗体，所以要定期检测乙肝病毒DNA。如果病毒呈阴性，可以考虑打加强针加强乙肝疫苗的刺激，看是否会产生表面抗体。
乙肝疫苗在注射第一针后，30%的人产生表面抗体，第二针后50到70%的人产生表面抗体，第三针90%的人产生表面抗体。在全程注射完乙肝疫苗一个月后，应再次检测乙肝表面抗体产生抗体。
每个人接种乙肝疫苗后产生抗体的时间都不一样，乙肝疫苗的接种，需要在六个月内注射三针，正常接种第一针乙肝疫苗以后，就会有约30%的人产生乙肝表面抗体，但是抗体的滴度不高，效果很不稳定，在接种第二针疫苗以后，会有约有90%的人产生抗体，而在接种第三针疫苗后抗体的阳性率可以高达96%以上，而且抗体的滴度很高，免疫效果非常好。就是说接种乙肝疫苗后疫苗产生表面抗体的时间，多数人都在六个月以上。
乙肝疫苗打一针产生抗体定量大于100至少可以持续5年-7年，抗体的水平越高，持续的时间越长，就算抗体水平下降，也能起到很好的保护作用的，因为乙肝的免疫是有记忆的功能的。