咳嗽时间不同，考虑的疾病也是不一样的，例如患者出现了夜间的咳嗽，考虑咳嗽变异性哮喘或者是心功能不全可能性比较大；如果患者出现了晨起的咳嗽伴有咳痰，考虑慢性支炎、肺脓肿、支气管扩张等相关疾病可能性比较大。
是一种正常的生理防御反射，偶尔咳一两声是正常的生理现象。早上天气比较凉，儿童刚起床受到寒冷空气的刺激，支气管会发生痉挛而引起咳嗽，还有经过一夜的睡眠，呼吸道里存在一定的分泌物。
每日晨起咳嗽，亦为呼吸道炎症中最为多见之症状，白天早晨起床后，交感神经就会兴奋起来，此时呼吸道黏膜上的纤毛就会活跃起来，便表现为有咳嗽，期望藉由咳嗽将呼吸道内炎症分泌物排走，故咳嗽为正常保护性反应。此时不需要特殊治疗。
但是，如果婴儿早上咳嗽伴有发热、哭闹等不适症状，则考虑是不良病症引起的，应该及时前往医院就诊检查，以免耽误病情。
一般情况下，宝宝早上咳嗽可以采取药物治疗、日常护理等方式进行治疗，缓解相关症状。具体内容如下：
1.药物治疗：宝宝早上咳嗽可能是支气管炎导致的，家长可以尽快带宝宝前往正规医院，在医生指导下使用盐酸氨溴索注射液、注射用头孢曲松钠、注射用青霉素钠等药物进行治疗。
2.日常护理：家长要注意室内的空气清新，避免空气污染刺激宝宝的支气管。
三岁宝宝每天早上咳嗽，咳嗽较为严重，要到医院就诊，在家庭护理当中要适当给孩子多喝点温热水，避免受凉。注意不要乱用药，要到医院检查之后明确病因之后进行治疗。
醒来就咳嗽的现象还是比较常见的，最常见的原因还是发生了呼吸系统感染，在晚上睡觉的时候人体的咳嗽中枢会受到抑制，所以咳嗽的现象就会减弱，会出现睡着不咳嗽，醒来的时候就会出现咳嗽。