扁平疣治疗上可以用物理疗法或药物疗法、中医中药疗法等。物理治疗主要选用液氮冷冻和激光治疗、疣组织包埋疗法。中医中药疗法有耳后放血法、火针法、穴位注射法等。药物治疗可以服用增强免疫的药物，因为扁平疣多发生于免疫力低下人群，免疫力增强后，有自身清除病毒的可能，扁平疣是有自愈性的。
扁平疣是由病毒感染引起的疾病，容易发生在面部，由于扁平疣具有一定的传染性，尽量不要抓伤和刺激，可以先外用软膏局部试试，如果没有好转可以去医院进行检查，根据医生指导用药。
扁平疣通常就是比较常见的病毒性皮肤，可以选择冷冻的方法进行治疗。
扁平疣主要是因为人乳头瘤病毒感染所造成的，如果存在皮肤破损的情况，有可能会导致人乳头瘤病毒通过皮肤破损处侵入，还会感染皮肤表皮细胞，并且会复制以及增殖，从而会导致细胞异常分化和增生，形成良性增生物。
如果存在扁平疣，可以通过冷冻的方法进行治疗，就是利用液态冷冻液反复点在扁平疣的部位，能够使扁平疣产生不可逆的损害，还可以消除人乳头瘤病毒，从而对于扁平疣可以达到较高的治疗效果。
治疗办法有，药物治疗，物理治疗，包括冷冻及激光治疗。激光、冷冻等，治疗方针，根据病情的严重程度选择适宜的治疗措施，控制症状，提高患者生活质量。若不及时治疗会累及更多的皮肤，也可能传染给家人朋友。扁平疣患者要多吃蔬菜、水果，补充多种维生素，这样对于扁平疣患者的皮肤较好。
自愈性的可能性是不大的。而且它的传染性很强，如果没有及时的治好就有可能会传染到其他的位置，所以建议在医生的指导下选择一些抗病毒的药物治疗，患者可以去医院做激光冷冻等治疗。
