两者最大的不同在于过敏性咳嗽只是咳嗽感受器敏感性增加，病变通常不累计气管支气管，咳嗽虽剧烈，但往往不会出现气紧的表现，气道反应性不高，肺功能通常是正常的。而咳嗽变异性哮喘则不同，咳嗽变异性哮喘本质仍然是哮喘，也可认为是轻度哮喘，病变累及气管、支气管，肺功能会有异常，气道反应性明显升高，在咳嗽时往往有气紧的情况。
过敏性咳嗽是一种通俗的说法，在临床上是没有这个诊断的，咳嗽变异性哮喘是一个医学上的诊断，是慢性咳嗽中的一种，是支气管哮喘的一种特殊的形式。那么它形成的原因就是过敏原因导致的气道的高反应，以及气道的慢性炎症，从而出现的以咳嗽为主要表现的症状。所以说咳嗽变异性哮喘，也就是一种过敏性的咳嗽，两者都是过敏引起的。
过敏性咳嗽和过敏性哮喘不一样。首先，过敏性咳嗽和过敏性哮喘都属于过敏性疾病，第二类是呼吸道疾病，第二类是变态反应性疾病，也可以发展为过敏性哮喘，初期，小孩不喘的时候，只会出现咳嗽，但是一旦发现肺部功能有限制，这就是喘前期的病变，如果病情恶化，咳嗽没有得到很好的控制，气道的高反应性会变得更强，通气功能会下降，这时候就会出现过敏性哮喘，这两者并不是一种病，而是一种联系。
过敏性咳嗽和过敏性哮喘区别是过敏性咳嗽不会有喘息的症状出现，而过敏性哮喘却有，过敏性咳嗽通常都不会有发热现象出现。并且咳嗽也会是在早上或是晚上出现，根本不会有喘息的症状，而哮喘的症状主要是呼吸困难，胸闷，喘息以及咳嗽。
过敏性咳嗽和过敏性哮喘是有本质区别的，过敏性咳嗽多数是接触了一些容易过敏的东西引起的一个气道高敏感反应。而过敏性哮喘，主要是一个气管的收缩，气道高敏感反应。引起反复发作，带有哮鸣音的一种表现。
儿童过敏性咳嗽与哮喘都是属于过敏所致的。过敏性的咳嗽一般是症状较轻的过敏，如干咳。严重过敏就会表现为过敏性哮喘，导致气管、支气管及肺部的平滑肌痉挛，出现严重的哮喘症状。过敏性的疾病，急则治其标缓则治其本。也可以考虑中医治疗，也可以在当地找个靠谱的中医辨证治疗。
