自然流产第三天了腰疼可能是多种原因导致的，具体分析如下：
如果女性在自然流产后三天会感到腰痛，可能是由于受了某种寒气的刺激，也可能是由于没有休息好，也可能是由于工作过度导致的。在流产后要多休息，不要过度劳累，不要做太多的体力活，要让自己的情绪得到充分的释放。同时要注意保持外阴的卫生，经常更换卫生巾，在一个月之内不能同房。需要到医院做个全面的检查，确定是什么导致了自然流产，然后才能对症治疗。
自然流产以后出现腰痛，考虑是在流产以后未得到及时的恢复，而导致的后遗症。在自然流产以后，一定要注意休息，避免劳累，不要吃辛辣、冰冻的食物以及冷饮。在流产的时期，女性的机体抵抗力比较弱，如果不注意外阴的清洁卫生，很容易导致子宫内膜炎、盆腔炎及附件炎。
坐的时候可以将软的枕头，坐垫垫在身下，使自己坐着感到很舒服，睡眠的时候采取左侧卧位，双腿屈曲，减少腰部负担。流产后腰痛有可能与瘀血流至盆腔，导致盆腔阻塞，或是子宫位置稍有移动，压住腰部神经造成，可进行检查。
很多妇女产后会出现腰痛，这种腰痛由多种原因造成，如生产期激素水平改变后，导致骨关节周边的韧带和肌肉发生松弛；另外在生产过程中，不恰当的用力导致某些肌肉的损伤；还有产后不恰当的哺乳姿势也是导致产后腰疼的原因。所以产妇应保持正确的哺乳姿势及生产期保养。
腰疼尿黄不一定是肾炎。肾炎的主要临床表现以血尿、蛋白尿、高血压、水肿为主。而腰疼、尿黄并不一定是肾炎的症状。因为肾脏里面没有痛觉纤维，基本肾炎并没有疼痛感觉。
及时去医院做一个腰椎间盘磁共振检查，看看是否存在什么问题，平时注意尽量不要腰部负重。一定要注意休息，避免长时间一个姿势，避免劳累，外伤，受凉，端正身体姿势，定时改变姿势，睡硬板床，腰围固定，休息的时候拿下来。腰背肌功能锻炼。
