中医治疗肾结石和输尿管结石效果不好，肾结石的形成是由于尿中晶体物质浓度升高，析出结晶并在局部生长、聚集的结果，结石活动会出现疼痛和血尿，中医中药有促进结石排出作用，常用于辅助治疗。
自发排石，对于较小的结石，可以通过多饮水，多运动促进结石排出，对于直径大于6毫米的结石，由于其直径大于输尿管内径，一般无法自行排出体外，往往需要进行体外震波碎石。
尿管结石伴有肾积水，提示已出现梗阻性肾病，建议积极排石治疗，尽早解除梗阻。根据结石的大小，可以采取内科治疗和外科治疗。如果结石直径小于0.6cm，一般通过应用解痉的药物，比如654-2，钙离子拮抗剂，多饮水，多运动可以排除体外。如果结石超过0.8cm，就要采取外科治疗，比如体外震波碎石，或者是输尿管镜，或者是开放手术治疗。
及时的去医院做个肾脏彩超或者是尿路造影，有堵塞需要及时碎石或者手术取石治疗。输尿管结石肾积水，影响了新陈代谢，输尿管结石肾积水的治疗要根据结石大小、部位、数目、形状、一侧或两侧、有无尿流梗阻、伴有感染、肾功能受损程度。
输尿管结石微创手术方法包括输尿管镜和经皮肾镜手术。要根据输尿管的具体位置来制定，一个是从腰部做切口，另一个是直接从尿道植入输尿管镜。也可以采用经皮肾镜碎石取石，这其中也包括气压弹道、超声碎石、钬激光这些媒介方式，输尿管下段的结石可以采用经尿道输尿管镜下碎石取石。
输尿管结石导致肾积水，建议马上应该到医院进行进一步的检查。应该做B超检查，可以发现结石在输尿管的什么位置、结石的大小、数量、肾积水的程度、输尿管扩张的程度，根据这些做出具体的判断，该怎样进行处理。如果结石小于0.5cm，建议多喝水，吃排石药，可以将结石排出体外，适当的运动，这样结石排出可能会更快。