功能性消化不良的治疗方法有一般治疗和药物治疗。
1.一般治疗：功能性消化不良，需要养成良好的生活习惯，尽量戒烟戒酒，合理膳食，规律作息。
2.药物治疗：功能性消化不良，需要在医生的指导下使用奥美拉唑、莫沙必利、氢氧化铝凝胶、泮托拉唑等药物进行治疗。
日常生活中，应当注意充分休息，保证充足的睡眠时间，饮食方面应当忌食生冷油腻食物。
一般情况下，在消化科，功能性消化障碍是一种很普遍的病症，约有50%左右的患者会出现在医院。患者会出现各种症状，有人会出现腹部肿胀，也有人会出现打嗝、嗳气等症状，也有人会出现上腹部疼痛等症状。有些病人，会感觉到肚子里的不适，却又说不上来。功能性的消化障碍一般都是以上腹部胀满、饱胀感、早饱感为主，也就是说，只要稍微进食一下，肚子就会被撑的感觉。还有嗳气，也会有恶心、呕吐等症状，这些都是因为各种原因引起的，建议患者及时去医院就诊，查明病因后对症治疗。
一般情况下，功能性消化不良指的是出现上腹痛、腹胀、嗳气、食欲不振、早饱、恶心、呕吐等症状。如果患有功能性消化不良，患者可以口服复方消化酶、乳酶生、复方阿嗪米特、保和丸、枳术丸等辅助消化的药物进行治疗，有较好的治疗效果，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，以免对身体造成不良影响。患者平时还应注意饮食习惯，避免吃过于辛辣生冷的食物，因保持清淡饮食。
一般情况下，阴虚不建议做艾灸，艾灸会消耗体内阴液从而加重阴虚，在特殊情况下，可在医师指导下做艾灸。
阴虚的症状是属于热性的病症，在中医上来说要治热需要远热。艾灸是属于热治的方法，所以阴虚的状症是不能使用艾灸这种方法进行治疗。艾灸一般适合寒湿、阳虚的人，阴虚、血虚都不建议做。因为艾灸会消耗体内阴液，加重阴虚、血虚。
一般情况下，阴虚体质可以通过药物、食物等方面进行调养。具体内容如下：
阴虚主要是由于人体的阴液不足，导致机体组织失去濡养及不能抑制阳气，使身体出现一系列“干燥”、“虚火”的表现。。心、肺、胃、肝、肾都会出现阴虚，这是由于肾阴不足造成的，肾主一阴一阳，六味地黄丸是临床上比较常见的治疗方法。银耳、甘蔗、梨、百合、山药、枸杞、麦冬、鳖、龟肉、海参等都是滋阴甘凉的食品。辣椒、大蒜、韭菜、花椒、桂皮、干姜、羊肉、狗肉等辛辣刺激的温热食品。
功能性消化不良会有以下症状表现。
功能消化不良的临床表现有早饱感、上腹胀痛、饭后饱胀、灼热感等，部分患者出现焦虑、失眠、头痛、注意力不集中等。但是患者在发病过程中，其临床表现可能会有改变，发病较慢，且经常会出现复发。
患者平时应该注意天气变化，及时添减衣物，保持环境安静和室内空气新鲜，多吃含钙丰富的食物，如猪骨、猪蹄等。