肺结核的治疗最主要是针对结核分枝杆菌的抗痨治疗，抗痨药物有很多种，它们的副作用根据不同药物种类而不相同。可能会引起肝损伤，还会导致血尿酸升高，出现关节痛的现象。副作用大的情况下要赶快停药。
治疗肺结核的药物贵，肺结核这种疾病目前使用的药物主要有异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、对氨基水杨酸钠、乙胺丁醇，临床上一般采用多种抗菌药物进行联合抗菌治疗，这样可以避免患者过快出现耐药性。在服用药物控制期间，患者还需要定期检查肝功能，长期用药会伤害患者的肝脏，所以可以选择些保肝类药物。
表现没有特异性，仍然出现结核感染的症状，咳嗽、咳痰、咯血、盗汗、乏力、消瘦、精神萎靡、食欲不振、全身潮热等。最明显的表现就是经过系统的使用抗结核药物之后，结核的中毒症状仍然存在，甚至有加重的趋势。
对药物过敏的，可以先口服点抗过敏的药物。如果效果还可以继续坚持服用抗结核的药物。如果效果欠佳症状严重，病人难以忍受的话。需要换药，停药或者说是换用其他的抗结核的药物。
感冒引起的咳嗽，不会感染肺结核的。由于躯体疲劳，或者机体免疫力降低，很容易外感风寒而引起感冒，出现发烧，鼻塞症状，严重者可以出现呼吸道感染，如咳嗽，需要抗炎止咳治疗。肺结核属于呼吸道传染疾病，是由结核杆菌感染引起。需要痰培养结核杆菌阳性，才可以确定。
肺结核耐药可以治好的，但要比不耐药的时间要长些，不要灰心。不用手术。耐药性肺结核可以采用中西医结合方式治疗的。耐药性结核是指对多种抗结核药物同时产生耐药，就是说结核杆菌对常见的几种抗结核药物产生了抗药性，治疗效果很差。