脑炎穿刺检查一般指的就是腰椎穿刺进行脑脊液的检查。因为脑炎主要是指中枢神经系统的炎症反应，如果患者病变范围比较大，比较广泛，通过做头颅磁共振的检查，尤其是磁共振的平扫加增强是可以发现部分病灶，所以是有必要做脑脊液检查的，在有条件的医院是需要做穿刺检查的。
如果脑炎目前经过治疗，已经退烧，还是需要行腰椎穿刺来进行检测的，可以通过腰椎穿刺来监测一下颅内压，其次留取少量的脑脊液，做细菌培养和药物敏感实验，根据检测的结果，选择针对性的抗生素进行药物治疗。
脑炎穿刺要采取左侧卧位，局部用碘伏棉球消毒，戴手套，铺无菌洞巾，取穿刺点，用利多卡因局部麻醉，右手拿穿刺针延穿刺点垂直进入，待感觉到两次刺空感，拿出针芯查看脑脊液是否有流出，然后测压管测压，留取脑脊液送化验室做标本，术毕，拔出穿刺针。
一般情况下，脑炎做穿刺有危险，具体内容如下：
在进行腰椎间盘穿入的时候，会有一定的脑脊液从穿刺区排出，从而使脊索的蛛网膜下腔内的气压下降，此时，可能存在诱发其他病症的危险。如果病人脑中的气压下降，可能会造成脑部和脊髓的沉降，从而导致脑干在枕骨大孔处受到压迫，最终可能会引发脑疝。因此，脑炎病人做穿刺是存在一定危险性的。
脑膜炎是一种是化脓性细菌所致，治疗首先应在维持血压、纠正休克基础上，根据年龄、季节特点，有针对性地选择易透过血-脑脊液屏障的有效抗生素，为明确诊断可能会做，未经治疗的化脓性脑膜炎通常是致命的。早期高效广谱抗生素的应用使其预后大为改观。但重症或诊治过晚者，其病死率及致残率仍高。
