早上起来肚子疼拉肚子可以通过日常调理、药物治疗等方式进行治疗。
早晨醒来肚子疼拉肚子可能是因为头夜吃错了东西，所以可以调整一下自己的饮食习惯。晚上要做好腹部的保暖工作。根据西中医的观点，早晨起床后会出现腹泻，主要是因为肠胃的炎症，如果是直肠炎，可以在医生指导下口服左氧氟沙星颗粒、氧氟沙星片等抗炎的药物进行治疗。
腹泻所采用按摩的部位和按摩的手法，需要看腹泻的类型来决定。对于寒湿侵袭肠胃、脾胃运化失常所导致的腹泻，可以在同侧腰骶部，双手五指并拢，掌根上下推擦多次。而对于不洁饮食所造成的腹泻，可以按摩中脘，下脘，大肠俞，手三里等，用手指指端进行点压。对于肝郁气逆，脾失健运气机失调所造成的腹泻，可以按摩肝俞，大肠俞，以手掌逆时针按摩腹部即可。
如果没有头孢过敏史，腹泻可以吃头孢。如果拉肚子是被一些细菌感染所导致，吃头孢是具有一定效果的，但头孢药物不能乱吃。有些病毒性的或者是一些功能性的，吃头孢是没有什么太大作用。
孩子湿疹伴随拉肚子主要是由于过敏引起的,可以遵医嘱通过外敷药物和内服药物缓解。
可搽炉甘石洗剂或者是振荡洗剂，也可短期应用地塞米松霜或肤轻松软膏外搽。中药治疗湿疹也有一定的效果，可以选择紫草煎汤外洗。宝宝湿疹可能有链球菌感染，可以局部涂抹红霉素软膏和湿疹膏等。婴儿湿疹伴腹泻可以口服益生菌，通过调节肠道菌群预防和治疗。还可以内服苯海拉明、非那更、塞庚啶等。
每天早上起来拉肚子的原因较多，具体如下。
每天早上起来拉肚子多见于五更泻，这是因为肾阳虚衰，无法有效的滋养脾胃，导致肠胃的运化失调，往往会表现为脐部疼痛，在肠鸣后会出现拉肚子，同时还会有手脚不暖、腰腿酸软等症状，而且还会有一些喜热恶寒的症状。临床上可以选择温肾健脾、固涩止泻的方法，同时还可以服用四神丸来缓解。同时每天早上起来拉肚子也可能是胃炎、肠炎等胃肠疾病导致的，建议患者前往医院就诊。
早上起来拉肚子有两种，一种是病毒性的胃肠炎，可以服用思密达、泻立止泻、黄连素、磷霉素钙片等。第二类疾病属于病毒性疾病，与神经、精神、工作压力、饮食不洁、饮食不规律等都有关系。可以适当的调整自己的情绪，多休息，按时吃饭，可以服用一些止泻药或者是喝一些苹果水来缓解。平时要少吃辛辣油炸的食物，多吃容易消化的食物。