对于乙型肝炎来说，治疗是一个综合治疗。当然，最关键的治疗是抗病毒治疗，什么时候能够停药。对于保肝药来说，如果发病初始的时候肝功正常，需要服用保肝药。肝功正常以后保肝药就可以慢慢减量，停药。但是对于抗病毒药来说，停药非常慎重，分为不同的情况，如果是一个大三阳的患者来说，目前的指南认为吃核苷类食物，大三阳转成小三阳以后，维持治疗3年以后才可能停药。
慢性乙型病毒性肝炎患者抗病毒治疗时，一般建议患者不要自行停药，要经过专科医生的指导才能停药。
临床上有很多病人擅自停药，导致肝炎复发，甚至出现重症肝炎。乙型病毒性肝炎患者抗病毒治疗多久可以停药，一般需要三到五年的时间，主要是根据乙肝病毒载量的多少来决定是否要停药。如果发现乙肝大三阳到小三阳，乙肝病毒会一直转阴，需要观察一段时间才能确定是否可以停药或者通过抗病毒治疗。患者达到乙肝表面抗原转阴，甚至出现乙肝抗体，如果病毒为阴性，可以考虑停药，但这种情况非常罕见，所以大多数乙肝患者不能停药，甚至终身服药，停药标准非常严格，必须在医生的指导下进行。
乙肝停药主要包括抗病毒，包括口服核苷类药物和干扰素抗病毒。干扰素抗病毒停药的标准要结合实际情况来定。
一般来说，大三阳转成小三阳，病毒检测不出来，而且疗程满一年，乙肝表面抗原也没有下降的迹象，可以停药。如果乙肝表面抗原持续下降一年，那么干扰素的疗程可以延长到一年半到两年，因为有可能出现乙肝表面抗原转阴。如果是口服核苷类药物，至少要治疗四年以上的乙肝大三阳，大三阳到小三阳的治疗至少需要三年以上的时间。乙肝小三阳患者需要口服核苷类药物，直到乙肝表面抗原转阴。
最新乙肝停药标准是：大三阳患者抗病毒治疗一年后，如果出现HBV-DNA阴性、转氨酶恢复正常、出现血清转换（e抗原转阴，e抗体转阳），应继续巩固治疗至少一年。小三阳患者在抗病毒治疗一年后，如果DNA阴性、肝功能正常，应继续巩固治疗一年半。
乙肝病毒的传播途径主要是经过性传播，母婴传播和血液传播的乙肝病毒感染，目前已经经过治疗病毒载量转阴，还不能够停用药物的，如果已经服用抗病毒药物的情况下，如果乙肝表面抗原转阴了那么就证明已经康复了，可以停用药物。乙肝病毒感染者一旦开始服用抗病毒，药物，病毒转阴还不能提供药物的，还需要继续服用药物进行治疗。
如果是在乙肝病毒DNA转阴性之后，患者一般不能擅自停药，以免影响病情的控制。
目前对乙肝的抗病毒治疗主要是采用高效力、低耐药性的抗病毒药物，大多数病人服用3-6个月之后，会发现HBVDNA会发生转阴性，但是如果停药，可能会引起HBV的再次发作，也有少部分病人会有严重的肝炎症状，在医生的建议下进行治疗和停药。目前慢性乙型肝炎可以服用4年或更多的抗病毒药物，长期服用可以降低复发，少数病人推荐终生服用。