如果不经过手术治疗，自然预期寿命非常短，总死亡率能够超过60%。其中50%均在出生后一个月内死亡，74%在出生半年内分型的不同导致了死亡率的不同：50%的A型单心室的平均在14岁之内死亡；而50%的C型单心室在死亡。所以如果能够早期发现，应该积极早期手术治疗。
先天性心脏病一般与发育有关，所以治疗一般是选择手术治疗，只是根据情况，首先是判断是否能做手术，其次是确定什么时候做手术最合适，然后做出全面的判断，然后才会给出一个计划。
先天性之心脏病多由胚胎发育期所致，因心脏和大血管生成受阻或发育异常而导致结构异常，因而引起功能障碍。在小儿时期常见到肺心病和风湿热，其中以肺组织纤维化最为严重。本病患者易反复呼吸道感染，伴生长发育迟缓、体质差等，及口唇紫红，活动度大，胸闷气促伴晕厥，超声心动图和x线均呈特征性表现。在小儿时期发生者称为婴幼儿哮喘。但支气管哮喘的发病原因为气道的高反应性，本病较儿童或青少年期发病为多，常伴有家庭和个人过敏史，表现为反复喘息，气急不止、胸闷或者咳嗽是主要的表现，它的症状可以自行减轻，也可以经过治疗而减轻。患者常因急性炎症刺激和过敏因素导致呼吸困难、发热等临床表现，并在一定程度上影响睡眠与食欲。起病时二肺闻及弥漫哮鸣音，支气管舒张试验阳性者行心脏彩超检查、胸片未见明显异常。
建议及时前往医院就诊检查，然后合理进行治疗。
红十字协会有免费救助的，需要当地逐级上报申请。先天性心脏病临床包括室间隔缺损，房间隔缺损，卵圆孔未闭以及动脉导管未闭等。孩子患有先天性心脏病，病情不严重，会自行自愈。
先天性心脏病能自愈，如果是比较小的室间隔缺损，出生以后有自然闭合的可能，特别是发生于膜周部的时间隔缺损发生自然闭合的概率是非常高的，大多数情况发生于一周岁以内，最迟不超过四周岁。卵圆孔未闭大多数情况下在出生以后，5-7个月有自然闭合的可能。对于动脉导管未闭的孩子，出生以后一周岁以内也有自然闭合的可能。