男性生殖器上长小疙瘩可能是以下原因导致：
1.可能是平时不注重身体护理，出现珍珠疹导致的，此时不要过于担心,可以通过使用物理治疗的方法来缓解病情的。
2.也可能是毛囊炎引起，也可能是由于出现了尖锐湿疣等疾病导致的龟头部位有红色疙瘩,所以应该进行对症治疗。
3.有的患者如果出现了皮脂腺异位症，可能会导致局部有小疙瘩的产生，如果会有脂肪颗粒会引起阴茎根部出现了单个或者多个的疙瘩的产生。
男性平时应该有保持良好生活规律,如果出现了阴茎龟头上有疙瘩的症状，应该进行合理的治疗,平时多注意休息，不要过于劳累。
小阴唇长出一块小肉就像肿了一样，特别疼通常与外阴炎、过敏等有关，建议对症处理。
1.外阴炎：如果患有外阴炎，通常会累及小阴唇、大阴唇等部位，导致这些部位长出炎性疙瘩，可能表现为就像肿了一样的小肉，而且特别疼。一般需要按医嘱用药治疗，比如硝酸咪康唑乳膏、克霉唑乳膏、甲硝唑片等。
2.过敏：如果最近使用过卫生巾或者穿过洗内裤，小阴唇可能会因过敏而出现长一块小肉的情况，还可能伴有特别疼、瘙痒等症状。通常建议及时更换卫生巾、内裤，还需要按医嘱使用氯雷他定片、盐酸西替利嗪片等药物进行抗过敏治疗。
如果患者有异常的性生活接触史，要排除一下是否疣类。并根据结果对症处理，平时保持外阴干燥，注意个人卫生，多休息，饮食丰富，合理搭配，增加抵抗力。及时到医院的皮肤科就诊，建议常规检查，如果考虑为尖锐湿疣，建议局部微创治疗。
可能是卫生不好或手淫，细菌感染，不洁性生活等引起的，保持好患处卫生，避免摩擦搔抓，以免加重症状，男性生殖器长疙瘩需要注意生殖器感染的可能，比如像毛囊炎，疱疹，湿疣等，和外生殖器的卫生，衣物卫生，包皮过长等均是有很大关系的。注意卫生和饮食。
考虑是尖锐湿疣导致的。建议进一步检查，查明病因，遵医嘱治疗。避免不洁性交，坚决杜绝性乱。可能通过密切地生活接触传给家中其他人，提倡淋浴，不使用盆塘，洗浴后不直接坐在公共浴池的坐椅上;在公共厕所尽量使用蹲式马桶。
考虑是龟头炎和生殖器疱疹引起的，生殖器疱疹主要表现为生殖器出现水泡样疱疹，并伴有瘙痒疼痛等这种情况你应该到医院做相关检查，根据不同的情况采取不同的治疗方案。