超声介入治疗对于身体的危害不大，还会比开腹手术创伤面小，不过不论是超声介入手术还是，开腹手术，都不能完全避免病情的复发。做完手术后要注重一些饮食，荤素搭配，饮食多样化。多吃新鲜的蔬菜和水果忌辛辣刺激性的食物。
可以做超声介入治疗的，卵巢右侧巧克力囊肿比较大，可能会压迫周围的组织，还会引起月经失调，痛经等疾病，也可以做个腹腔镜手术治疗合适，手术后做个活检，需要排除恶性肿瘤的发生。
巧克力囊肿的治疗方法是超声下介入治疗，子宫内膜异位到盆腔，80%在卵巢上种植，因内膜组织与卵巢有亲和力，每月月经来潮时在异位内膜区域可形成出血，周围组织对其包裹而形成囊肿，内存陈旧性血液，呈巧克力色，故名巧克力囊肿。
超声介入治疗巧克力囊肿效果好。囊肿超声介入治疗是经皮穿刺抽吸囊液联合硬化剂硬化治疗，属于手术范围，在超声影像引导及监测下，利用直径约1.1mm的金属针，准确穿刺到囊腔内，穿刺过程全时监测，穿刺路径为经腹部或者经阴道，取决于病人是否已婚、囊肿位置高低以及穿刺路径障碍大小等因素。
巧克力囊肿不进行治疗，对于女性身体的健康的影响还是非常大的，尤其是不够重视疾病，病情越拖越严重，不但会影响到女性的正常生活，导致女性不孕，甚至恶变影响到生命安全，所以必须要选择正规的妇科医院进行治疗。