对于慢性肠炎、慢性细菌性痢疾、肠结核等肠道感染引起的感染性慢性腹泻，治疗上需针对病原菌进行抗感染治疗，如诺氟沙星、左氧氟沙星、奥硝唑等。
引起慢性腹泻的原因还有很多，建议就诊明确病因后针对性治疗，以免延误病情。需要注意的是，具体用药请结合临床，由医生面诊指导为准。治疗期间患者要保证充足的睡眠，不要吃油腻、不易消化的食物，比如啤酒、咖啡等，养成良好的生活习惯，有利于病情的恢复。
慢性腹泻的患者选择中药治疗的话，药材的选择一定要在中医指导下合理的用药！慢性腹泻尽早治疗很关键！在初期治疗的话效果是最理想的，如果拖延治疗的话，只会让病情变得严重治疗的难度加大。
母乳性腹泻是一种常见的疾病，如果出现了腹泻，首先要排除疾病，一般不适慢性腹泻。
母乳型腹泻的特征很明显，一天三到七次大便，大便是一种泡沫稀水样的，有一股特别的酸臭味，便便淡绿色，有泡沫，有时还会有一条半透明的粘稠液体。腹泻的时候没有发烧，没有明显的疼痛，也没有明显的哭闹，没有任何的感染，没有任何的症状，但是宝宝的精神状态很好，胃口也很好。
但如果腹泻的时间过长就比较严重，可能会导致生长停滞、营养不良等。
小儿慢性腹泻需要及时就医检查，明确具体情况后及时对症治疗，还要注意日常护理。
首先要做一次粪便的检测。主要看是不是因为肠胃不好或者是因为胃病。出现消化不良时，可以服用一些抗炎症的药物，病情较重，需要进行静脉注射。多饮水，多吃些容易消化的食物。日常生活中要保持良好的个人清洁，要经常洗手，不要食用辛辣和油腻的食品。
通常来说，慢性腹泻吃蒙脱石散、硫糖铝等药物。
腹泻是一种常见症状，俗称“拉肚子”，是指排便次数明显超过平日习惯的频率，粪质稀薄，水分增加，每日排便量超过200g，或含未消化食物或脓血、黏液，常伴有排便急迫感、肛门不适、失禁等症状，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，常用的药物主要有蒙脱石散、硫糖铝等。
小儿慢性腹泻是病程持续2个月以上的连续腹泻。
持续腹泻病程超过两个月考虑小儿慢性腹泻。临床上常见反复发作性腹泻及大便次数增多。慢性腹泻是由多种因素所致。感染、营养物质过敏、免疫缺陷、药物因素等，先天性的变形，急性腹泻没有得到彻底的处理或者处理不当，等，多见于儿童人工喂养及营养不良者。其病因主要是肠外营养不足或不能满足机体对各种营养素需要所致。慢性腹泻的治疗应重视肠道菌群失调的问题和饮食方面的问题。