卵巢囊肿在年轻的育龄期女性中发病率很高，患者一般也没有明显的症状。如果是比较大的卵巢囊肿，患者可能会在下腹部摸到一个包块。一般情况下，卵巢囊肿的诊断主要依靠B超、盆腔C等检查，这些检查不仅可以发现囊肿，还可以判断囊肿的性质是生理性或者病理性，对医生根据患者的身体情况以及病情，制成合适的治疗方案有一定的帮助。
医院检查有炎症性的卵巢囊肿，应该及时通过静脉点滴敏感的抗生素进行抗炎治疗，炎症消退之后囊肿就会逐渐消失掉，如果是由于先天因素导致的实质性的囊肿，需要采取手术切的，主要根据囊肿的大小位置以及是否造成功能性障碍决定治疗措施。炎症性卵巢囊肿，是由于输卵管炎症常波及卵巢，形成炎性积液、积脓，近而形成卵巢囊肿。准确地说它应该是炎性包块，而并非真性卵巢囊肿。
卵巢囊肿检查项目包括：妊娠试验、胃镜、纤维结肠镜、彩色多普勒超声、MR|、血清肿瘤标记物等，以及个别特殊情况下应用腹腔镜检查，可直接看到肿物的大体情况，在可疑部位进行多点活检并吸收腹液进行细胞学检查可确定诊断。
判断卵巢囊肿是良性肿瘤还是恶性肿瘤，主要依据以下几个方面：第一、卵巢囊肿要根据肿物的大小判断，囊性是否伴有出血、坏死，囊内容物是浆液性还是黏液性。一般恶性肿瘤会出现实性肿物，多彩状，伴有出血坏死等。第二、卵巢囊肿需要经过手术切除来进行病理检查，并根据组织细胞结构的特点来诊断，必要时应该结合免疫组织化学染色和基因检测从而进行有针对性的治疗。
卵巢囊肿有生理性的，也就是较大的卵泡检查，有可能会出现这一种症状，如果非排卵期出现卵巢囊肿，表示实质性的卵巢囊肿，有可能会影响卵巢的功能，甚至会造成输卵管堵塞。
卵巢囊肿恶性者有时为双侧，不活动，与周围组织常有粘连，部分为实性，表面不光滑，可能穿破包膜，种植在腹腔或盆腔内，在子宫直肠陷凹处可触到固定的结节，常伴有血性腹水，如抽吸腹水检查可能查到癌细胞。