巧克力囊肿属于子宫内膜异位的一种。一般药物治疗是没有什么效果的，目前看是囊肿不大，可以先观察，暂时不用手术治疗，只要是没有明显增长就没事。建议平时养成良好的生活习惯，不要熬夜，适当锻炼，月经期不要同房，避免发生阴道炎或是加重病情。
囊肿达到5cm以上手术治疗，不能保守治疗，治疗方法主要采用药物和手术治疗。去医院做b超检查。巧克力囊肿小于8厘米，可进行药物治疗。对于较大的要先手术治疗，及时就医，做相关检查，确定囊肿大小以确定治疗措施。应注意自身身体的变化，及时到正规医院进行检查和诊断。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症最常见的类型，治疗方法主要采用药物和手术治疗。在医院做b超检查。巧克力囊肿小于8厘米，可进行药物治疗。对于较大的要先手术治疗，及时就医，做相关检查，确定囊肿大小以确定治疗措施。应注意自身身体的变化，必须及时到正规医院进行检查和诊断，积极配合治疗，以免延误病情。
如果巧克力囊肿直径小于五厘米，没有合并任何不适，可以定期的复查。如果巧克力囊肿直径大于五厘米，并且是持续存在，需要手术治疗。巧克力囊肿是一种良性病变、恶性行为，特别容易复发。
手术方式有开腹手术和经腹腔镜手术两种。腹腔镜手术是本病比较适合的处理方法。目前认为以腹腔镜确诊、手术+药物为内异症治疗的选择。有条件的医院，腹腔镜手术应为内异症的首选治疗方法。
巧克力囊肿与中医的气滞血瘀有关，与宫寒，或是湿热的炎症引起的血瘀有关，需要中医把脉或四诊辨证检查诊断，进行治疗，主要是以活血化瘀，把巧克力囊肿消散掉，或是使月经调顺，月经正常，经来不痛。