子宫内膜异位症的治疗要根据患者的年龄、病情的严重程度、是否有生育需求来决定，具体的治疗方法有：
1、保守治疗：可以采用假孕术或假绝经治疗，在子宫中用药来控制女性的经期，从而达到假孕或者绝经的目的。
2、外科：现在采用的是微创技术，即腹腔镜，对病变进行全面的综合、根治性和半根治性的治疗，提高患者生存期、生活质量、怀孕率。
通常情况下，患者可以通过使用药物、手术治疗等方式进行治疗子宫内膜异位症。具体情况分析如下：
使用药物：子宫内膜异位症患者可以口服避孕药、促性腺激素释放激素激动剂（GnRH-a）、雄激素类药物（丹那唑）、孕激素受体拮抗剂（米非司酮）等。
手术治疗：年轻且有生育要求的患者，应进行保留生育功能手术；已有子女且患者年龄较大，应进行保留卵巢功能手术。
子宫内膜异位食疗在日常生活种可以多吃含n-3脂肪酸的鱼类，而且有些深海鱼含有11-3脂肪酸，也可以多吃雪菜，这些食物的物质能够有效的抑制前列腺素的产生，是一种天然的抗前列腺素的食物，吃起来更有益。
子宫内膜异位保守治疗：子宫内膜异位是可以通过药物来治疗的，药物可以使子宫内膜异位的病灶缩小，让症状减轻。通过药物治疗子宫内膜异位，目的是抑制卵巢功能，以诱发异位子宫内膜萎缩。
子宫内膜异位症不好治，目前没有很好的治疗方法。子宫内膜异位症是指具有生长功能的子宫内膜组织，由于某种因素的影响而在子宫腔以外的其他地方生长繁殖的一种病症。对妇女而言子宫内膜异位症是常见的病，有痛经、不孕等症状且容易复发等。
子宫内膜异位症的确诊主要是根据病人的症状，在月经期的时候会出现明显的痛经症状，通过B超检查在附件区，尤其是卵巢上会发现有巧克力囊肿，可以确诊为子宫内膜异位症。如果是子宫腺肌症，会伴有月经量增多，并且有进行性加重的痛经，导致不孕不育。通过B超检查会发现，在子宫肌层会有多个囊性的暗区，结合临床病史可以诊断子宫腺肌症。