超声介入治疗巧克力囊肿效果好。囊肿超声介入治疗是经皮穿刺抽吸囊液联合硬化剂硬化治疗，属于手术范围，在超声影像引导及监测下，利用直径约1.1mm的金属针，准确穿刺到囊腔内，穿刺过程全时监测，穿刺路径为经腹部或者经阴道，取决于病人是否已婚、囊肿位置高低以及穿刺路径障碍大小等因素。
建议按照医生的医嘱，今年相应的调理，同时注意在日常生活中少食辛辣刺激，生冷海鲜等食物。避免多吃刺激性强的食物，多吃蔬菜水果，补充维生素C。禁忌辛辣食物。新鲜蔬菜水果也要多吃。不宜常食刺激性、海产品等。
可以试试中药诊脉调理，对这种病有效果。注意姿势端正，调节情绪。注意休息饮食起居，少吃辛辣刺激，少吃膨化食品碳酸饮料。多喝温热蔬菜汤。热敷理疗，注意保持清淡饮食为主，忌食辛辣刺激性食物和过于油腻的食物，注意戒烟戒酒。
巧克力囊肿与中医的气滞血瘀有关，与宫寒，或是湿热的炎症引起的血瘀有关，需要中医把脉或四诊辨证检查诊断，进行治疗，主要是以活血化瘀，把巧克力囊肿消散掉，或是使月经调顺，月经正常，经来不痛。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病理表现形式，即子宫内膜正常应该在宫腔内，但是有一部分内膜异位到卵巢，所以巧克力囊肿里面都是血液，子宫内膜异位不容易怀孕，囊肿小可以行中医治疗，囊肿大建议行西医治疗。