治疗甲沟炎用碘酒涂擦或浸泡患趾，每日4～6次，每次15～20分钟，直到皮肤发白，利用碘酒的消毒作用将病变的皮肤组织给腐蚀掉，让它重新生长，以防甲沟炎。或者涂抹修复液，也可以治疗甲沟炎的。
甲沟炎确诊后，医生会根据甲沟炎患者的病因和类型，炎症影响的范围以及脓肿是否形成等情况来制定不同的治疗方案。早期可用热敷、理疗等，使用抗生素进行治疗。已有脓液的，可在甲沟处作纵形切开引流。
治疗甲沟炎没有最快的药膏说法，通常可选用对革兰氏阳性细菌敏感的药膏，如红霉素软膏或百多邦软膏进行治疗。
甲沟炎是一种常见的外科感染性疾病，甲沟炎的致病菌主要是革兰氏阳性细菌，如金黄色葡萄球菌。
另外，如果是由霉菌感染引起的甲沟炎继发，需要同时服用达克宁软膏等抗霉菌药物。如果甲沟炎的症状比较严重，需要通过拔甲术进行手术治疗。
早期可用热敷、理疗等，可以应用抗生素。进行快速治疗，已有脓液的，可在甲沟处作纵形切开引流。感染已疲倦疲乏、无力及指甲基部皮下周围时，可在两侧甲沟各作纵行切口，将甲根上皮片翻起，切除指甲根部，置一小片无菌纱布或乳胶片引流。如甲床下已积脓，应将指甲拔去，或将脓腔上的指甲剪去。
甲沟炎就是发生在甲沟部位的感染。最常见的感染细菌还是金黄色葡萄球菌，因为细菌在表皮是广泛存在的，比较常见的因素就是局部组织的刺伤、擦伤，或者指甲往里面生长，出现拔倒皮刺的时候，这些因素造成的，而治疗一般是出现早期甲沟炎，治疗还是比较简单的。
