针对病因进行治疗，有与肛瘘、痔疮等其他疾病引起的直肠炎，要及时对相关疾病进行治疗，及时去除诱因。对于血吸虫感染引起的直肠炎进行去除血吸虫治疗。对症治疗，直肠炎会引发一系列的肠胃症状，对于腹泻病人，可以使用止泻药进行止泻治疗。对于直肠过于疼痛病人进行止痛治疗，注射止痛药物等，同时还可以进行中医中药治疗，以达到最大的治疗效果。
有排便异常，有便秘、腹泻或便秘腹泻交替出现，血便、粘液便或脓血粘液便，有粘液或粘液血便腹痛，可有轻至中度下腹隐痛。清除异物和注入药液，用手指将异物通过腹壁捏碎并向后移送，或者借助钳子，通过肛门弄碎并取出。
首要先做肠镜，明确下具体的病因才能清楚，对症下药。平时注意腹部保暖，避免受凉。要饮食有规律，一日三餐做到定时定量，不过分饥饿、不暴饮暴食，这样有利于肠道消化平衡，避免因无节制饮食而致肠道功能紊乱。
及时到医院进行准确治疗，听从医嘱，直肠炎引发的原因一般都是因为长期的脾虚导致的，脾虚食物不能及时的消化吸收，堆积在肠道内，对肠道粘膜组织造成刺激，刺激了肠道粘膜组织，就引发了充血水肿的情况，这样就长期引发了直肠炎的发生。多吃蔬菜水果；多喝水；避免吃辛辣、油腻、油炸、生冷食物；避免暴饮暴食、不洁饮食、食无定时；减少或避免抽烟、喝酒。
肠炎通常会用一些方法减轻直肠黏膜水肿，口服一些药物，改变肠道的菌群，给予一些益生菌药物。医院肛肠科有些病人，采用把弥散的He-Ne激光导到直肠腔里，做黏膜照射也能够起到很好的治疗作用。