小儿肛周脓疡并没有最好的处理方法，只能选择对其进行最好的处理，通常采用的是保守疗法，外科治疗。
非手术疗法
1、婴儿的肛周脓肿的情况比较轻，可以使用外敷的药物，例如外敷的红霉素。2、用热水来进行坐浴，尤其是在大便之后要用清水清洗，可以通过热水坐浴来加快局部的血液流通，也可以到正规的医院进行物理理疗。
2、外科疗法
如果小儿的肠管出现了严重的脓疡，应立即进行开腹引流，以免发展为肛漏。术后要注意使用抗生素，同时要注意肛周的卫生。
婴儿肛周脓肿其实是小儿肛周脓肿的一种。肛周脓肿是一种常见的病症，小儿肛周脓肿的发病率也在不断增加，原因是由于婴幼儿饮食不合理，或者是长期腹泻所致。肛周脓肿是一种炎症性炎症，病情发展的很快，如果不及时处理的话，脓腔就会迅速扩张，从而导致病情的恶化。
对于婴幼儿的肛周脓肿，一般有两种方法，一种是消炎，使用消炎药物，可以控制脓腔的面积，从而控制炎症。第二种，就是直接做外科手术，先把脓水剖开，再修剪一下，把感染的坏死组织去掉，等恢复了正常的组织。
要及时的去医院接受正规的手术治疗，不要自己乱买药物给小孩服用，要听从医生的嘱咐去治疗。注意营养合理，食物尽量做到多样化，多吃高蛋白、多维生素、低动物脂肪、易消化的食物及新鲜水果、蔬菜，不吃陈旧变质或刺激性的东西，主食粗细粮搭配，以保证营养平衡。
如果是经过手术治疗之后复发了，那就得需要积极的进行治疗，防止这样的病症进一步的发展。可以选用一些抗菌消炎的药物进行治疗，也可以再加一些别的药物来联合进行服用治疗，合理饮食，均衡营养，饮食习惯上也要多注意少吃辛辣刺激性，过与油腻的食物，凉东西。平时注意保暖，避免感冒，加重病情。多喝水，少喝浓茶。
肛周脓肿手术后、不要急着运动，要等伤口愈合后才可以进行运动，要适当的运动，增强抵抗力，肛周脓肿手术后，可以在床边自己走走，不然剧烈的运动会使伤口开裂的、病人会出现疼痛，一系列的症状的出现，手术后要注意休息等愈合后就可以适当的运动了。肛周脓肿术后提肛运动可以存进肛门部位的肌肉收缩促进血液循环，对愈合有好处，但是不用一直做。
检查肛周脓肿要到肛肠科，多数正规综合医院都会设立肛肠科的。如果没有肛肠科就挂普外科。轻微肛周脓肿是可以保守治疗的，具体就是局部用药加上肛门护理和改善不良生活习惯。如果恶化下去有可能导致肛瘘等更严重的问题。