任由肛瘘发展，会对括约肌造成严重损伤，甚至可能造成肛门失禁等并发症。肛瘘的多发会形成直肠阴道瘘、直肠尿道瘘和直肠膀胱瘘，危及周围脏器，并且多年未治或误治的老肛瘘有癌变的可能。肛瘘的多次反复发作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而成多发性、复杂性肛瘘，不但给治疗带来困难，而且也影响到肛门的生理功能。
肛周脓肿早期是发生于肛门、肛管和直肠周围的急性化脓感染性疾病，属于细菌感染，是肛瘘的前身。肛周脓肿发生后应认真对待，发生在肛门两侧的坐骨直肠窝和骨盆直肠窝及男性前侧的会阴筋膜下的脓肿最为凶险，如果不及时处理，可能会导致感染性休克。
肛周脓肿早期是发生于肛门、肛管和直肠周围的急性化脓感染性疾病，属于细菌感染，是肛瘘的前身。肛周脓肿发生后应认真对待，发生在肛门两侧的坐骨直肠窝和骨盆直肠窝及男性前侧的会阴筋膜下的脓肿最为凶险，如果不及时处理，可能会导致感染性休克。
婴儿肛周脓肿早期的最为明显的症状，就是婴儿肛门周围软组织表现为皮下脓肿，并逐渐向外扩散形成，婴儿会感觉到持续性的疼痛，运动时疼痛现象会加剧，婴儿会表现比较焦躁，婴儿患上婴儿肛周脓肿，常常可以在婴儿的肛门附近，观察到有明显的皮肤红肿现象，并且触摸后，会感到明显的硬结感和波动感。
对于肛周脓肿初期，可以选择手术治疗，将脓肿切开进行详细探查，脓腔的分泌物，留取进行细菌学的化验。另外，要清拭脓腔壁，避免残留。术中可能会有一些出血的发生，手术以后，脓腔首先应该进行填塞。
高位肛周脓肿是指位于肛门外括约肌以上的肛周脓肿。高位肛周脓肿一般全身症状会比较重。在临床上常见的症状可能出现发热、头痛等症状。这主要是细菌感染后出现的全身毒素反应。对于高位肛周脓肿的手术治疗。直接进行切开，敞开脓腔时需要谨慎，可能会引起肛门失禁大多数高位肛周脓肿都是采用切开脓腔加挂线的治疗方法进行治疗的。