小儿在腹泻时多少都伴有肠道菌群的紊乱，可服用一些肠道微生态制剂，或肠黏膜保护剂。肠道微生态制剂和肠黏膜保护剂可以帮助缩短腹泻病程，效果良好。婴儿腹泻治疗方法具体还要看孩子的病情。病症重则需要去医院就医。
不存在“最好”的说法。一般情况下，腹泻可能是脾虚湿盛、脾胃气虚、暑湿外感等原因引起的，对症治疗的效果比较好，具体内容如下：
1.脾虚湿盛：如果患者因为脾虚湿盛而出现了腹泻的情况，应遵医嘱使用参苓白术散等药物对症进行治疗。
2.脾胃气虚：如果患者脾胃气虚，还有腹泻的症状，患者可以在医生指导下使用补中益气汤来改善不适症状。
3.暑湿外感：如果患者出现腹泻是暑湿外感所引起的，患者可以遵医嘱使用藿香正气散等药物。
虚寒腹泻通常仍可用药，经常使用的药是妈咪爱，培匪康也有丽珠肠乐之类的口服。还可以使用蒙石脱散、乳酸菌素片、乳酸菌素颗粒、肠炎宁片等，可以缓解身体不适。
小儿腹泻按其病因分为感染性与非感染性2类，它是一种以腹泻为主要表现的多因素、多病原所致的临床综合征，平时应注意保暖以免感冒。用药期间患者应该注意休息，规律作息，避免熬夜，并且注意保暖，避免着凉，避免吃辛辣、刺激的火锅、冰淇淋等食物，以免影响药效。
小儿治疗腹泻可以服用益生菌，如合生元、妈咪爱，可以改善肠道微生态，也可以服用中药帮助健脾胃。
不能给孩子滥用抗菌药，细菌导致的腹泻才能用抗菌药物，不要滥用收敛止泻的药物，急性期不能用，严重腹泻、呕吐导致脱水、酸中毒，若不及时处理容易有严重的后果，情况严重时要及时到医院治疗。久治不愈的腹泻导致食欲减少，可以煮胡萝卜汤给孩子喝，可以有效缓解腹泻。
儿童按摩对痢疾有很好的疗效。对儿童由于食物造成的损伤，以及由于寒风所致的各种腹泻，都有很好的治疗作用。
儿童按摩是一种治疗痢疾的常用手法。
有一种手法，所有人都很清楚，那就是触碰。就是用手去触摸孩子的肚子。这种肚皮按摩是在肚皮上做一次温柔的触摸。
孩子拉肚子的时候，要顺肠道的蠕动来做爱。
因此要格外留意，小儿拉肚子时，要把握好按摩的方向。若触碰的是反向的，效果会起到反效果，使腹泻加重。
治疗腹泻的药一般有以下几种：
引起腹泻的因素包括急慢性胃炎、十二指肠溃疡、急慢性结肠炎、急慢性结肠炎、胃肠型感冒、柯萨奇病毒引起的胃肠型感冒、细菌感染引起的细菌感染等。治疗腹泻的药物使用也不尽相同。奥美拉唑、阿莫西林、硫糖铝、枸橼酸铋钾等都是急慢性胃炎、胃溃疡、十二指肠溃疡等。急性结肠炎导致的痢疾可以口服环丙沙星、固本益肠片等药物。痢特灵、氧氟沙星等都是治疗细菌性痢疾的药物。