任由肛瘘发展，会对括约肌造成严重损伤，甚至可能造成肛门失禁等并发症。肛瘘的多发会形成直肠阴道瘘、直肠尿道瘘和直肠膀胱瘘，危及周围脏器，并且多年未治或误治的老肛瘘有癌变的可能。肛瘘的多次反复发作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而成多发性、复杂性肛瘘，不但给治疗带来困难，而且也影响到肛门的生理功能。
宝宝患有肛周脓肿，属于外科病，需要去儿外科治疗，如脓肿明显需要脓肿切开引流治疗，黄疸2月仍不退，属于病理性黄疸。去医院挂儿外科看肛周脓肿，因为有肛周脓肿的高危因素，可能会引起败血症，黄疸有可能是败血症引起，应采血常规、血培养及脓液的细菌培养，来指导抗生素的治疗。
应该去医院的普外科检查治疗，如果已形成脓液，应该切开引流。肛周脓肿一般由肛腺感染引起，初期表现为红肿热疼，形成脓液后，疼痛减轻。平时要注意休息，多喝热水。还要注意卫生。
少数肛周脓肿用药物，热水坐浴及局部理疗等可以消散，但多数需要手术治疗，单纯性脓肿的治疗可在截石位或侧卧下，用局麻或腰麻，在脓肿部位做放射状切口，放出脓液后，伸入食指探查脓腔大小，分开其间隔。必要时将切口边缘皮肤切开少许，以利引流，最后用纱条放入脓腔做引流。
新生儿肛门脓肿应及时治疗。如果症状不是很严重，可以选择使用局部清洁来缓解病情，这可以是自愈的。如果新生儿平时不注意合理的身体保健，可能导致肛门脓肿的发生，或使出现明显的亚健康症状。
因人而异，如果经常便秘的人，是非常容易引发肛周问题的。肛门脓肿一般是肛门周围皮下脓肿。多由肛腺感染经外括约肌皮下部向外或直接向外扩散而成。主要症状是肛周持续性剧痛，受压或咳嗽时加重，行走不便，坐卧不安，全身感染症状不显。