切勿轻视结肠炎比较好的治疗时间，治疗越早效果越好。结肠炎的众多，而多数人都不注意结肠炎的治疗。中医认为，结肠炎是由饮食不节、精神刺激、感受四时疫情，治疗不当、迁延日久、寒湿热功当量三邪蕴结而成。病程日久、反复发作、顽固难愈、易转癌变。
直肠粘膜水肿者，可用生理盐水、鞣酸、灌洗直肠。粘膜糜烂者，可涂醋酸可的松溶液或硝酸银溶液。括约肌、肛提肌痉挛者，可将温橄榄油注入直肠内。临床上，用蜂蜜、芝麻油各50-100毫升和黄霉液50-100毫升，隔一天交替保留灌肠，每天2次，有很好的疗效。
一般情况下，直肠炎最佳治疗方法是药物治疗。具体情况分析如下：
直肠炎是一种比较常见的肠病。直肠炎患者可以通过口服、肌肉注射或静脉滴注等方式进行药物治疗，同时口服和口服药物进行调理。直肠灌洗是治疗直肠粘膜水肿的有效方法。如果是直肠粘膜糜烂，可以用硝酸可的松溶液或硝酸盐溶液来治疗。其次，从中医角度来说，可以通过理气疏肝的方式来进行肝的调理，并要注意饮食习惯。
直肠炎的治疗有灌肠，对于粪便硬块嵌顿导致的直肠炎应采取灌肠，解除粪便压迫。由于引发直肠炎的病因较复杂，治疗原则应根据引发直肠炎的病因及疾病采取相应的治疗措施。可以通过粪便、涂片或活检组织进行细菌、真菌和病毒检测；相关抗体及毒素测定。要注意休息和饮食。
直肠炎在初期时是治疗时间。可采用中药理气舒肠方治疗，西药治疗，中西药结合灌肠。也可以采用心理疗法。可予高营养、低脂、少渣易消化饮食，白扁豆、苡米等煮粥，常食健脾养胃。
中西药结合灌肠：采用独有中药配方“肠炎i号方”配合西药研粉混合保留灌肠，经临床验证疗效满意。病人自己也需要注意。要注意休息，不要过度劳累，劳逸结合；饮食上注意清淡，进食营养丰富、无刺激性的食物，比如小米粥、可以健脾养胃；同时要保持心情愉快。