肠炎按病程长短不同，分为急性和慢性两类。治疗一般为保护胃肠黏膜、补液支持、补充肠道菌群、锌剂的补充等来治疗。如果继续母乳喂养期间，持续出现胀气、水样便现象，可怀疑乳糖不耐受，在母乳喂养时添加乳糖酶即可。
孩子腹泻应该首先明确病因，才能对症治疗，普通的对症止泻处理，如果孩子存在乳糖不耐受或者食物过敏，则需要去除诱因，或者添加乳糖酶等才能好的快。注意卫生，防止交叉感染*进食、开奶及喂饲前，如厕及替病童换尿片后，必须洗手。
宝宝现在有这个肠炎，那么除非是威胁肠道益生菌进行治疗的，另外不要吃小花卷的，还是要注意喝一些粥来促进消化的，要注意避免辛辣刺激油腻的食物。需要注意多喝水，而且注意饮食卫生，平时注意身体保暖，增强个人体质的。
直肠炎的治疗方法包括：1.一般治疗：适当休息，进清淡、少渣、营养丰富、无刺激性的食物，并做到心情愉快，劳逸结合；2.药物治疗：修复肠黏膜，缓解出血症状；3.穴位埋线：可长期刺激穴位，促进血液循环，加快炎症吸收，加速溃疡愈合。
小孩肠炎可使用头孢类及其他消炎药，此外，还可给予头孢类消炎药，思密达接受治疗并大量饮水，防止脱水发生，还要注意营养的补充，注意勿吃辛辣刺激性食物、加强运动，增强自身免疫力、避免感冒、多喝水，如病情较重，就医治疗。可以遵医嘱服用蒙石脱散、乳酸菌素片、乳酸菌素颗粒、肠炎宁片等药物进行治疗。并且注意保暖，避免着凉，避免吃辛辣、刺激的火锅、冰淇淋等食物，以免影响药效。
直肠炎需要病因治疗，由于引发直肠炎的病因较复杂，治疗原则应引发直肠炎的病因及疾病采取相应的治疗措施。其次灌肠对于粪便硬块嵌顿导致的直肠炎应采取灌肠，解除粪便压迫。