虽然手术治疗对肛乳头瘤是治疗性的，但要严格掌握其手术时机。要根据其病情不同时期的发展，采用相应的综合治疗方法，对早期的采用一些预防性的治疗，对不能手术的病人，在治疗的同时，配合中药灌肠治疗，以提高疗效。在手术当中要注意保护肛管皮肤，尽量减少对肛管皮肤的损伤，避免后遗症的发生。
如肛乳头较大，一般主张手术治疗，与肛裂一齐处理。坐浴法：热水坐浴每日1-2次，局部热敷，改善血液循环促使炎症的吸收。使用药物涂以乳头上，可以治疗。平时要注意休息，多喝热水。
肛乳头瘤是要通过手术切除的方式来消除的，这样会比较彻底，要积极的治疗，以免耽误病情，增加治疗的难度。饮食要注意清淡为主，不要吃辛辣刺激的食物，对于控制病情也是有帮助的。
肛乳头瘤可以到肛肠科检查明确，肛门清洁卫生，必要时手术治疗。忌辛辣刺激，饮食清淡，避免便秘，注意肛门清洁卫生，可以应用药物，必要时肛肠科手术治疗。也可以外用涂抹消炎药物，多注意观察。
一般来说，肛乳头瘤症的症状如下：
肛乳头瘤，是肛门周围良性疾病，其症状有：一是肛门异物，用手挤压异物时，无疼痛无出血，边界清楚，质地较软，表面光滑。二是肛乳头瘤的基底部牢固，蒂较长，常突出肛门口，进行肛门镜检查时很容易就发现了。
建议术后注意不要对肛门造成刺激，避免出现肛门痉挛，导致肛乳头瘤再次复发，还要做好伤口周围的卫生护理措施，避免伤口感染，出现伤口肿胀的现象。
肛乳头瘤治疗：早期积极治疗肛窦炎症是预防肛乳头瘤的关键。对较大的肛乳头瘤，若有脱出，应及时送回肛内，以免发生水肿及嵌顿、坏死、出血等。肛乳头瘤为良性肿瘤，本病一般认为有恶变趋向，主张早期手术治疗，以开放性手术切除为主。