对于肛周脓肿，西医常用的是抗生素，可以通过口服或者静脉点滴来进行治疗。
对于肛周脓肿，可以在浅浅的地方涂抹，如果是在皮肤比较浅的地方，那么就可以进行手术。反之，局部脓肿不是消失，而是扩大，或者是软化，就是已经形成了脓液，可以通过切口排脓。对于小儿肛周脓肿，父母要立即送到正规的医疗机构进行正确的处理，以促进病情的好转。上述药品需要在医生的指导下服用。
肛周脓肿化脓以后就会触及到波动感，需要进行手术及时的切开排脓，对于表浅的肛周脓肿，可以选择口服药物治疗，如果是范围比较大的脓肿，需要手术方式还要具体的病情来决定。
肛周脓肿最有效的治疗手段是选择手术进行切开引流，如果是表浅的脓肿，在一级医院进行手术，费用应该是在1000元到2000元之间，如果选择三级医院，费用需要翻倍。因为肛周脓肿属于肛周的急性感染，在手术以后还需要进行常规的抗感染治疗，并且术后定期换药，对于高位的脓肿住院的周期比较长，所以说病人花费也会比较多。
肛周脓肿，在各大城市三甲医院都可以治疗，如果已经出现肛周的脓肿，一般的治疗方法就是手术治疗，局麻下给予手术切开引流脓肿，将脓肿里的脓液排出，减轻肛周的疼痛、肿胀感。对脓肿内给予消毒，用碘伏、双氧水冲洗，之后放入药条，每天进行常规的换药，使脓肿能够逐渐的减小。根据肛周脓肿的病因，再进行下一步的治疗，多数都是肛瘘引起的，可能需要再次切除肛瘘。
治疗肛周脓肿治疗，一般是需要及时切开引流，排出脓液，并且定期进行换药处理，以观察伤口创面的愈合情况，后期可以在每次大便之后，使用消炎溶液坐浴，另外，肛周脓肿的病人需要酌情进行抗菌素治疗，可以根据病情给予口服、肌肉注射或者静脉滴注。
肛周脓肿可以考虑手术治疗，如果不积极治疗，肛周脓肿破溃后会形成肛瘘。确诊肛周脓肿后，积极手术治疗，需要应用抗生素药物，手术后积极的换药，大部分都效果不错。另外要注意保持肛门清洁。