肠炎通常会用一些方法减轻直肠黏膜水肿，口服一些药物，改变肠道的菌群，给予一些益生菌药物。医院肛肠科有些病人，采用把弥散的He-Ne激光导到直肠腔里，做黏膜照射也能够起到很好的治疗作用。
少吃辛辣刺激性的食物，保持规律的生活习惯和饮食习惯。注意保持心情的舒畅。直肠炎是可以治疗的，一般是使用中药保留进行观察，或者是使用复方黄柏叶进行灌肠，然后使用麝香痔疮膏和普济栓赛高，同时尽量避免疲劳熬夜。
直肠炎的治疗包括饮食治疗，腹泻期要注意补充营养，适当减少饮食中纤维素成分，以易消化富含叶酸、铁、钙、镁、锌等微量元素的流质饮食为宜。心理治疗，做好思想工作，尽量全身放松。
异物的损伤，是最常见的病因，一些不消化的异物可以引起直肠粘膜的损伤的，从而导致直肠炎。良性肿瘤恶变，也可以引起直肠炎，比如一般的直肠家族性息肉可以恶变。饮食的原因，高脂肪、高蛋白或者是低纤维素的饮食，与直肠炎的发病有明显的关系。有毒的化学品，比如各种杀虫剂不小心服下以后可以导致直肠粘膜的损伤，引起直肠炎。
直肠炎到医院检查需要挂消化内科，属于慢性结肠炎的一种，需要肠镜检查才能确诊的，轻微直肠炎的治疗可以采取保守治疗，通过药物进行治疗。日常生活中要注意多喝水，忌食辛辣刺激性的东西。