一般情况下，治疗肛裂的特效药主要包括内服可外用药两种。内服药主要包括麻仁滋脾丸等保持大便通畅药物；外用药主要是高锰酸钾。
肛裂的治疗是多种药物、多种方式共同作用的结果，常用的药物包括高锰酸钾、硝酸银、镇痛油膏、硝酸甘油膏、硝苯地平、地尔硫卓、肉毒杆菌毒素等。可以使肛门括约肌松弛，减轻疼痛，同时改善局部的血液循环，促进炎症的吸收，有利于肛裂的愈合。
对于肛裂，保守治疗2周未愈者，首选扩肛术。对陈旧性肛裂首选内括约肌侧切术。但是总的原则是首先要预防、防止大便的干结，以免再次损伤肛管皮肤，另外要促进炎症的吸收防止感染，其次要促进伤口的愈合从而达到治疗肛裂的目的。
肛裂的主要现象就是肛门疼痛和出血，如果疼痛减轻或者出血较少，就说明症状已经好转了。这时就要多注意吃一些清淡饮食，少吃辛辣的食物，并且多喝水，尽量保持大便湿润，再保持多运动就行了。
肛裂的治疗方法很多，注射法疗是较常用的一种方法。以往多采用单纯封闭治疗，近年来研制不同注射药物治疗肛裂，收到较好效果。是以麻醉药物和长效止痛剂注射至病灶及其周围组织，解除疼痛和括约肌痉挛，使裂损创面得到修复。
痔疮肛裂并没有什么特效药，对症治疗，平时注意保养是很快会恢复的，每天要用生理盐水清洗肛门，相关药物水坐浴，可以外涂点消炎药膏，也可以口服消炎药物治疗，多吃点粗纤维的食物，多吃点新鲜的蔬菜水果，少吃辛辣的食物。