肛瘘的手术价格要根据肛瘘复杂程度，高位肛瘘还是低位肛瘘来确定，费用在4000元-20000万左右。
对于低肛瘘，如果患者选择门诊手术和局部麻醉，费用要低得多，如果是单纯的肛瘘，二级医院的手术费用约4000元，三级医院的手术费用约为8000元。如果是复杂的肛瘘，二级医院的费用在6000元以上，三级医院的费用在10000元以上。如果是高复杂性肛瘘，费用会更高，可能在2万元左右。包括术前相关检查费用、手术费用、床位费用、护理费用、换药费用等。
对肛瘘疾病进行微创手术操作，费用会相对比较高一些，大概是6千元-8千元不等。这是因为肛瘘微创手术操作，对患者肛门部位的创伤性比较小，伤口容易愈合，愈合时间也较短，但是手术操作难度相对大一些，所以费用会增高。
每个地方的收费都是不一样的，大概在5千元左右，肛瘘病人在手术初期，宜食少渣柔软易消化的食物，一方面术后消耗较大，卧床时间长，消化功能减退，应尽可能减轻消化道的负担；另一方面避免粗糙干硬的粪便对术后伤口的刺激，减轻疼痛。
肛瘘微创治疗的费用决定于其自身肛瘘的复杂程度。临床上肛瘘有多种类型，如简单型肛瘘和复杂肛瘘、高位肛瘘和低位肛瘘、单外口肛瘘和多外口肛瘘等。肛瘘越简单，其治疗过程就简单，治疗时间也短，治疗费用也低。肛瘘越复杂，其治疗过程就麻烦很多，治疗时间更长，治疗费用就明显增加。所以，微创治疗肛瘘，简单的肛瘘治疗费用在五千元以内，复杂的可能超过三万元。
一般费用在2千元左右。肛瘘手术的费用都不是特别高，可以去正规的医院接受治疗，价格相对比较公道。肛瘘多数的肛周脓肿后留下的后遗症，是肛门处常见多发病之一，手术费用每家医院不一样。手术后要注意患处卫生，按时清洗。要去当地公立医院肛肠外科手术治疗，术后按时消毒或坐浴。
