肛门会瘙痒剧烈。久而久之可使身体虚弱消瘦，精神不振，抗病能力下降，多次反复发作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而成多发性、复杂性肛瘘，也会影响到肛门的生理功能。
肛周囊肿的在治疗上可以采取抽脓减压来帮助治疗，采取局部消毒，减轻脓腔张力，缓解疼痛，如果脓肿较为严重时，可以将囊肿切开，排出脓液，为进一步减少手术创伤，可采取双向等压引流手术治疗，术中采取半切割挂线。
如果是已经形成了肛瘘，就要立即手术，因为时间长了，容易形成多个瘘管，增加手术的复杂性和痛苦。越早手术越好，因为这与医生的技术和经验有很大关系，所以要到正规的肛肠专科医院手术治疗，这样能很快得到治疗。还不复发。
肛周囊肿得去医院接受治疗，做手术。术后日常饮食中可多选用蔬菜、水果、豆类等含维生素和纤维素较多的饮食，少吃辛辣刺激性的食物，如辣椒、芥末、姜等，否则会加重病情。感染是引起肛周脓肿的主要原因。因肛裂、痔疮、肛窦炎、肛门周围皮肤毛囊汗腺炎及肛门周围皮肤病等感染，可形成肛门直肠周围脓肿。
轻度肛周脓肿可以说是不严重，一般是可以自愈的，但是，在此期间，要注意饮食，避免进食辛辣刺激性食物，避免长时间坐着蹲，可口服或注射广谱抗生素，防止炎症扩散，缩小其限制和缓解肿胀和疼痛，如果保守治疗不明显并且脓肿逐渐增加，则需要手术治疗。
