如果是已经形成了肛瘘，就要立即手术，因为时间长了，容易形成多个瘘管，增加手术的复杂性和痛苦。越早手术越好，因为这与医生的技术和经验有很大关系，所以要到正规的肛肠专科医院手术治疗，这样能很快得到治疗。还不复发。
治肛周囊肿大约需要7-10天的时间。多数需要手术切开脓肿，充分引流脓液，防止其不断扩散，以减轻疼痛等症状。伴有肛瘘的肛管直肠周围脓肿，要治疗必须先处理肛瘘，局部可用中药的溶液坐浴，使会阴保持清洁。同时应用抗生素控制感染。
首先做肛诊检查看一下脓肿的程度，如果脓肿很大，周围肿胀疼痛应该及时的手术彻底切开脓肿充分清理冲洗脓液引流才能很快好转的。除非很小的脓肿可以服用抗生素消炎。可以逐渐恢复正常的。
早期肛周脓肿怎么治疗到三甲以上医院肛肠科检查一下，可以做肛门指诊检查，肛镜检查等。查找病因对症治疗。如果刚开始。局部清洗后可以涂抹药膏等药物治疗。同时服用消炎药等。生活中注意调养，按时作息，少熬夜，多喝水，多吃新鲜的水果和蔬菜，忌食辛辣等刺激性食物，保持大便通畅。
肛瘘的治疗原则是将瘘管切开，形成敞开的创面，促使愈合。肛瘘不能自愈，不治疗会反复发作，需要手术治疗。肛瘘的手术方式很多，手术是减少肛门括约肌的损伤，防止肛门失禁，同时避免肛瘘的复发。