想要预防肛周脓肿，首先就要增强自身的体质和抗病能力，多参加体育锻炼，不要久坐、久站。促进肛门附近的血液循环。可以多吃一些粗纤维的食物，粗粮和青菜都可以预防肛周脓肿。
不能打预防针。肛周脓肿会在一定的程度上伴有一定的红、肿、热、痛，可以有局部发热，也可以伴有全身的发热。注射预防针很明显的一个禁忌症就是发热，因为肛周脓肿是可以引起发热，并且是身体细菌感染的情况，是不能够注射预防针。
积极锻炼身体，增强体质，增进血液循环，加强局部的抗病能力，预防感染。避免久坐湿地，以免肛门部受凉受湿，引起感染，另外不要长久站立。养成良好的卫生习惯，养成每日便后洗洁局部的习惯，防止感染。不食刺激性强的食物，这样有利于大便的排泄。
平时注意局部卫生，勤换内裤，便后清洗肛门，积极治疗与肛周脓肿有关的疾病，如果肛门出现不适时，尽早诊治。不吃或少吃刺激性食物，多吃容易消化又营养丰富的食物，多吃新鲜蔬菜，不吃变质食物，以预防肠道传染病，注意休息，防止过度疲劳，增强机体抵抗力，防止便秘，从而达到预防肛周脓肿的目的。
饮食方面要以清淡为主，不要吃辛辣刺激性食物，少饮酒，多吃蔬菜水果，多吃含高纤维食物，保持大便通畅，以防便秘。同时不要久坐，适当运动，避免引起痔疮等导致肛周脓肿的发生。注意卫生。