直肠炎初期治疗主要是包括几个方面。首先生活饮食调理，进食少渣、清淡、营养丰富无刺激的食物，保持心情愉悦。其次积极对症治疗，症状明显的病人可以局部用药，可以选择痔疮类的栓剂，当有大便嵌顿者保留灌肠，急症、重症者选用免疫抑制剂或是激素类药物。
可以清除异物和注入药液用手指将异物通过腹壁捏碎并向后移送，或者借助钳子，通过肛门弄碎并取出。在实施该项操纵时，应小心认真，避免直肠受到损伤。在出现严重努责时，应事先应用镇静剂后再操纵。清除异物后，向直肠内注入含有磺胺制剂的橄榄油。灌肠将微温水、碳酸氢钠溶液、橄榄油或甘油灌注到直肠内。根据需要，逐日灌肠。
肠炎通常会用一些方法减轻直肠黏膜水肿，口服一些药物，改变肠道的菌群，给予一些益生菌药物。医院肛肠科有些病人，采用把弥散的He-Ne激光导到直肠腔里，做黏膜照射也能够起到很好的治疗作用。
少吃辛辣刺激性的食物，保持规律的生活习惯和饮食习惯。注意保持心情的舒畅。直肠炎是可以治疗的，一般是使用中药保留进行观察，或者是使用复方黄柏叶进行灌肠，然后使用麝香痔疮膏和普济栓赛高，同时尽量避免疲劳熬夜。
直肠炎的治疗包括饮食治疗，腹泻期要注意补充营养，适当减少饮食中纤维素成分，以易消化富含叶酸、铁、钙、镁、锌等微量元素的流质饮食为宜。心理治疗，做好思想工作，尽量全身放松。