和局部潮湿，不卫生有关，可以服用抗过敏类药物加外用药物进行治疗。平时注意清淡易消化饮食，忌辛辣刺激的，戒烟酒，保持大便通畅，每天热水坐浴，保持局部的干燥，透气，卫生。
肛门湿疹可以外用疗法，原则与接触性皮炎的治疗相同。看皮损情况选用适当剂型和药物。对小范围亚急性湿疹应用糖皮质激素霜剂，糖皮质激素的口服或注射不宜使用，激素虽对消炎、止痒及减少渗出的作用较快，但停用后很快复发，长期应用易引起许多不良反应。
肛门湿疹可以使用清洗的药物坐浴，涂抹外用尿素药膏进行治疗。肛门湿疹是因为局部长期潮湿，受到摩擦等不良刺激造成的，恢复较慢，治疗后容易复发。要生活规律，适当参加体育锻炼，不要搔抓刺激肛门周围皮肤，清淡饮食，多吃蔬菜和水果。
治疗肛门湿疹应该去当地比较正规的三甲医院接受正规的治疗。大多数的三甲医院治疗肛门湿疹的效果是一样的，只有一些不知名的小医院治疗效果会比较的差劲，因为小医院的治疗手段比较少，医疗条件也是相对十分有限。
中医的肛门湿疹，多半是用吃中药来治疗的，但是的宝宝年龄太小，中药很苦而且中药的见效也比较慢，还是尽量不给宝宝用中医去治，还是采用外用药涂抹的方式适合宝宝，可以采用对人体没有刺激的中药来治疗，平时要保证宝宝肛门的卫生。