内分泌导致子宫内膜薄首先要避免子宫内膜的损伤，减少人工流产的频率，平时同房的时候要做好避孕措施，佩戴避孕套或口服避孕药物，避免反复人工流产使子宫内膜进行新的变薄，影响以后的正常妊娠，同时平时可以多吃一些含有雌激素及补血的食物如豆制品。
传统中医法：子宫内膜薄在中医理论中是多属于肾虚、气血两虚，以致气血不能濡养，冲任失调。可以通过中药治疗，补气养血、益肾健脾，使子宫内膜逐渐增厚。但传统中药一般见效较慢。也可以手术治疗。
月经量偏少，从而引发子宫内膜太薄，应采取补充生长激素来调理。适量的雌激素、孕激素可以在一定程度上增加子宫内膜的厚度，改善子宫内膜薄的症状，然而激素的危害很大，长期使用会导致器官衰竭，免疫能力急剧下降等。
子宫内膜薄的原因，可以分为全身因素和局部因素。全身因素有内分泌失调，内膜薄的局部因素主要是内膜发生损伤、粘连或者缺如等。治疗这种疾病应该根据个人的具体情况，选择适当的方法。治疗方法主要是根据病因补充激素或者进行手术治疗。
人流术后子宫内膜薄，中医多断为肝肾虚弱、气血不足证，调理此类的方法如下：饮食上多吃豆制品以及血肉有情之品。豆制品如大豆、黄豆、黑豆等；血肉有情之品包括牛肉、羊肉、猪肝、动物胎盘等；服用补肝肾、益气血的中药，选用补益气血的穴位进行针灸治疗。
如果是人工流产以后或者是刮宫后引起的子宫内膜变薄，这种很可能就是子宫内膜的损伤或是出现了宫腔的粘连，需要做阴道镜检查。口服雌激素治疗，可以促进子宫内膜的生长，使子宫内膜修复的。如果是内分泌失调引起的，也就是没有排卵出现雌激素分泌降低，这种时候要调整内分泌促排卵治疗的，只要有正常的排卵就会分泌雌激素，子宫内膜就会生长，平时多吃一些大豆类的食物。