子宫内膜薄的治疗首先要确定是什么原因引起的，如果是内分泌紊乱引起的雌激素缺乏引起的要进行补充雌激素的治疗，人工周期治疗三个月，如果是子宫内膜损伤，之前有人流清宫的病史，有可能是宫腔粘连引起的。所以除外宫腔粘连引起的子宫内膜薄，一般需要三个月的治疗。可以化验一下激素六项，做个彩超看看，确诊是什么原因后才好对症治疗。
如果子宫内膜厚度少于五毫米，就叫做子宫内膜过薄，常见的原因就是频繁多次的人工流产，或者是子宫先天发育不足引起的。治疗上主要是补充孕激素，促进子宫内膜增厚，一般可以考虑孕酮联合补佳乐治疗，需要在医生指导下选择合适的药物剂量，不可以自行用药。
一般情况下，人流后子宫内膜薄是因为做人流的时候会对子宫的内膜造成伤害，如果是反复做人工流产而引起的，那么可以口服屈螺酮炔雌醇片进行3个月的时间来进行调理，这样可以加快子宫内膜的恢复。另外，在做完人工流产手术之后，可以通过服用一些具有补气养血的药物来帮助子宫的内膜变薄，从而让子宫的收缩功能回归到原来的水平。还可以通过八珍益母丹和紫河车来进行调理。
因为多次流产而导致的子宫内膜薄，要考虑积极的选择雌孕激素等调经治疗，帮助改善内膜的情况。在治疗的同时应该增加营养。饮食上一定要注意不要吃辛辣刺激性的食物。要定期做复查。可以多吃一些蔬菜和水果还有豆制品。还要注意自己性生活的清洁，内裤也要勤洗勤换。
治疗子宫内膜薄比较好的医院是哪个没有确切的答案。子宫内膜异位症是妇科疾病中的疑难杂症，近几年发病率也越来越高了，但是子宫内膜异位症是可以治疗的。得了子宫内膜异位症后也不要过度担心，因为子宫内膜异位症经过治疗后便可以怀孕。病人只要坚持用药，是可以康复的。