如果输卵管积水量比较少，可保守治疗。若输卵管积水量较大，或已形成较大的输卵管卵巢囊肿，一般保守治疗效果不好应考虑手术治疗。输卵管积水多为双侧性，与周围组织很少粘连，对年龄较轻的病人，如卵巢外观正常，可以分离输卵管与卵巢粘连，切除输卵管，保留卵巢。
输卵管积水要做手术，输卵管积水是慢性附件炎症的，应用药物效果不好，选择微创腹腔镜输卵管积水手术，输卵管有堵塞，可以宫腹腔镜联合输卵管疏通。手术以后一个月，月经干净需要复查输卵管通水。
治输卵管积水中药能直达病所，消炎止痛，利水渗湿，直接治疗输卵管积水疾病。这是因为中药功效：清热消毒药，能直接杀死引起炎症的各种细菌和病毒，促进积水的吸收。利湿药，即渗水利湿，促进机体吸收积水，活血化瘀和软坚散结的药物，这些药物时帮助输卵管消除粘连、消肿，促进积水排出。
输卵管积水是输卵管炎症造成的，所以说，治疗输卵管积水首先要口服消炎药进行治疗。平时要注意休息，忌辛辣食物，不要熬夜；待口服消炎药孕周后，到医院复查，也可以做输卵管通液进行治疗，大多数的输卵管积水是可以治疗的。
如果输卵管的近端是通畅的，但是远端有积水，这时候就可以采取卵管造口术治疗，可以在很大程度上恢复输卵管的功能，目前进行卵管造口术的方法有开腹手术，也有腹腔镜手术。
输卵管积水除了治疗外，饮食也非常重要，合理的饮食可以起到缓解输卵管积水症状的作用。输卵管积水在饮食上多吃芹菜，油菜，芝麻，香椿，绿豆，文哈，赤豆，陈小麦，荞麦，燕窝，章鱼，鱼翅，乌骨鸡等食物病情的治疗有好处。